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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004278`

染色体: Chr05 坐标: 56572834-56575389 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004278`
名称	SmilChr05G004278
描述	F-box protein At1g70590
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	56572834 - 56575389 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025330`
GeneID	`131025330`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025330`
原始查询	`SmilChr05G004278`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box protein At1g70590
产物	F-box protein At1g70590
Arabidopsis	`AT1G70590` (AT1G70590) F-box family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843396] identity=60.4; qcov=1.04; evalue=1.77e-145; confidence=high
Rice	`Os04g0476000` (Os_F0756) - identity=50.4; qcov=0.836; evalue=1.56e-83; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF08238 (Sel1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025330

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057811040.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.60000	`XP_057811040.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057811040.1`
4	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057811040.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811040.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:56573068`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B16,B48,B77,D4
`Chr5:56573075`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B72,C42,C81
`Chr5:56573117`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr5:56573194`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr5:56573519`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B84,C23,C42,C81
`Chr5:56573531`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,B1
`Chr5:56574205`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B70,D5
`Chr5:56574210`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B84,C13,C23,C81,C9
`Chr5:56574270`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,B1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811040.1

342 aa

171

342

F-box

Sel1

PF00646 F-box 59-94 aa PF08238 Sel1 106-134 aa PF08238 Sel1 153-167 aa PF08238 Sel1 170-197 aa PF08238 Sel1 203-237 aa PF08238 Sel1 239-273 aa PF08238 Sel1 279-304 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811040.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	59	94	1.5e-05	25.4	F-box domain
`XP_057811040.1`	Pfam	`PF08238`	Sel1	Repeat	106	134	5.8e-24	84.4	Sel1 repeat
`XP_057811040.1`	Pfam	`PF08238`	Sel1	Repeat	153	167	5.8e-24	84.4	Sel1 repeat
`XP_057811040.1`	Pfam	`PF08238`	Sel1	Repeat	170	197	5.8e-24	84.4	Sel1 repeat
`XP_057811040.1`	Pfam	`PF08238`	Sel1	Repeat	203	237	5.8e-24	84.4	Sel1 repeat
`XP_057811040.1`	Pfam	`PF08238`	Sel1	Repeat	239	273	5.8e-24	84.4	Sel1 repeat
`XP_057811040.1`	Pfam	`PF08238`	Sel1	Repeat	279	304	5.8e-24	84.4	Sel1 repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955057.1
TTATATAGGTCATCCTTTTTATTAAATAAAAACCGACCTTTTCTTAAAAATAAATTGACCAATTAATTAATTTAATTAATTAATATATTTCTCAGTATGATTTATTATTGAATATTTTGTGAACACACACGCACTCTAAGCTCGTCTGACGCAGCTGTACCGCCACCTCTCGCCGCCGGCCGCCGGCGCCGCTGAGCTCCCCGCGATGAAGCAAATGACGTGGCCGTGCAATTCCGAAGGCCACCATCACTTCGCATCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025330
ATGAAGCAAATGACGTGGCCGTGCAATTCCGAAGGCCACCATCACTTCGCATCGCTCCCCTTTTTCAGGAAGCCCCATGACTCCCCAACTCCGGCCAAACCCTCCAAACCCCACCTCTCGTTCTTCAATTCGGGCCCCAAATCGCCGCCTCGTCCGCCGCCGCAGGGATCGGATTTCTCGGCGTTGCCGTACGACGTGCTGGCGAGGATCGCGGCGCCGTTCGCGCTGCCGAGCCTGAAGACGGCGTCGCTGGTGTGCCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811040.1
MKQMTWPCNSEGHHHFASLPFFRKPHDSPTPAKPSKPHLSFFNSGPKSPPRPPPQGSDFSALPYDVLARIAAPFALPSLKTASLVCRAWRDALKPLREAMVFLKWGKRFKHGRGGVKANSRKALDSFLKGAARGSTLAMVDAGLIYWEMGKKEEGIAWYRLAAELGDPTGQCNLAICYLQAHPSKTGEAIGWLYQASFAGHVRAQYQLALCLHQGRGVGRSLPEAARWYLRAAEGGYVRAMYNTSLCYLMGEGLVQSHRL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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