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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004302`

染色体: Chr05 坐标: 56723231-56723957 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004302`
名称	SmilChr05G004302
描述	uncharacterized SmilChr05G004302
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	56723231 - 56723957 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026169`
GeneID	`131026169`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026169`
原始查询	`SmilChr05G004302`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G25270` (AT3G25270) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822121] identity=29; qcov=0.76; evalue=4.81e-10; confidence=low
Rice	`Os02g0118800` - identity=28.7; qcov=0.956; evalue=8.59e-16; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026169

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057811921.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057811921.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057811921.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811921.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811921.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:56723362`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	44	A15,A6,A8,A9,B11,B113,B118,B120,B131,B134,B21,B27,B28,B32,B37,B4,B44,B48,B55,B60,B65,B69,B89,B90,B92,B95,C1,C17,C19,C20,C33,C37,C45,C48,C51,C52,C53,C55,C60,C64,C65,C66,C86,D5
`Chr5:56723382`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C24,C3
`Chr5:56723424`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,C32,C87
`Chr5:56723432`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr5:56723452`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr5:56723482`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	89	A1,A10,A23,A24,A25,A6,A9,B1,B105,B107,B112,B117,B12,B120,B126,B129,B13,B130,B133,B136,B137,B16,B18,B22,B23,B24,B26,B29,B33,B35,B38,B39,B40,B47,B49,B5,B50,B51,B52,B54,B55,B60,B62,B66,B67,B72,B79,B82,B85,B86,B89,B93,B94,B95,B97,C1,C15,C18,C2,C29,C31,C32,C36,C38,C39,C40,C41,C43,C44,C46,C47,C52,C55,C58,C6,C61,C63,C65,C68,C75,C76,C81,C82,C86,C87,D2,D4,D8,D9
`Chr5:56723488`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B127,C1,C5
`Chr5:56723489`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B29,C24
`Chr5:56723490`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B10,C32
`Chr5:56723499`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B37,C24
`Chr5:56723499`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B37,C24
`Chr5:56723526`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,C51

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811921.1

204 aa

102

204

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 17-111 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811921.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	17	111	4.4e-21	76.1	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955938.1
ATGGGTACTAAAGATGGCTGGATATGGGAAGCTTCCAAGGATGGAAGATACTCCATTAAATCAGTGTATGAGGTGATTAAAGCTCAACGGAGTGAAAATGGTCTTCAACGGTCTGATATGAAAGTTCTGGCGTCGGTGTGGAAGACGCCTGCCCCACAGAAAGCAATTGTTACTTCGTGGAGACTGCTGCGCAATCGTCTTCCAACGTGCGACAATCTGAGGAAAAGGAAGATCAATATGAGCGAGGAAGATCTACAGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026169
ATGGGTACTAAAGATGGCTGGATATGGGAAGCTTCCAAGGATGGAAGATACTCCATTAAATCAGTGTATGAGGTGATTAAAGCTCAACGGAGTGAAAATGGTCTTCAACGGTCTGATATGAAAGTTCTGGCGTCGGTGTGGAAGACGCCTGCCCCACAGAAAGCAATTGTTACTTCGTGGAGACTGCTGCGCAATCGTCTTCCAACGTGCGACAATCTGAGGAAAAGGAAGATCAATATGAGCGAGGAAGATCTACAGTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811921.1
MGTKDGWIWEASKDGRYSIKSVYEVIKAQRSENGLQRSDMKVLASVWKTPAPQKAIVTSWRLLRNRLPTCDNLRKRKINMSEEDLQCCFCQDHEEDTNHMFISCPKTQELWDEIQRWTGISTAQPFAAAAHWLNFSECGQNKKGRKLLKAIWMSCCWLLWKRRNEIRFEGKTWEVNNLILEIKVRVWSWNKIFGVVDFDLDFAQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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