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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004304`

染色体: Chr05 坐标: 56749148-56750722 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004304`
名称	SmilChr05G004304
描述	protein JINGUBANG-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	56749148 - 56750722 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025355`
GeneID	`131025355`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025355`
原始查询	`SmilChr05G004304`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein JINGUBANG-like
产物	protein JINGUBANG-like
Arabidopsis	`AT1G24530` (AT1G24530) Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839068] identity=55.7; qcov=0.851; evalue=7.5e-134; confidence=high
Rice	`Os02g0740900` (OsWD40-54) - identity=40.6; qcov=0.958; evalue=3.63e-87; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00400 (WD40)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025355

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811071.1`
2	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057811071.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811071.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811071.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811071.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:56749464`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B106,B121,B84,B94
`Chr5:56749467`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B106,B121,B84,B94
`Chr5:56749628`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B126,B78
`Chr5:56749725`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B69
`Chr5:56749725`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B69
`Chr5:56749880`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C71,C75
`Chr5:56750166`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D9
`Chr5:56750166`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D9
`Chr5:56750209`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B128
`Chr5:56750209`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B128
`Chr5:56750313`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr5:56750513`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811071.1

424 aa

212

424

WD40

PF00400 WD40 206-240 aa PF00400 WD40 246-281 aa PF00400 WD40 293-327 aa PF00400 WD40 340-371 aa PF00400 WD40 380-420 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811071.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	206	240	4.6e-35	119.3	WD domain, G-beta repeat
`XP_057811071.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	246	281	4.6e-35	119.3	WD domain, G-beta repeat
`XP_057811071.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	293	327	4.6e-35	119.3	WD domain, G-beta repeat
`XP_057811071.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	340	371	4.6e-35	119.3	WD domain, G-beta repeat
`XP_057811071.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	380	420	4.6e-35	119.3	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955088.1
CATACATATCAACCCTTTCTTTGTCTCTCCTATAGTCCATATTAGCACTCCAAAACACACTCTCTCTCTCTCCGCCGGCAGCAAATAAAAATGAAGGTCCGATCTTGGCTATCAACATGCTCCTCCGCCACCTGCATCGCCACCTCCGACGCCGCCGCCCCATCTCCGCCACTAACCCTATTCCCTCCACCAAAATCCCTCTTCTCCGACACCAGCAGCAGCAGCTACTCCGATAACTCCCAAACCAACAGCAGCATCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025355
ATGAAGGTCCGATCTTGGCTATCAACATGCTCCTCCGCCACCTGCATCGCCACCTCCGACGCCGCCGCCCCATCTCCGCCACTAACCCTATTCCCTCCACCAAAATCCCTCTTCTCCGACACCAGCAGCAGCAGCTACTCCGATAACTCCCAAACCAACAGCAGCATCCAATCCAACCTCTCTCTCCTCACCCTCCCCTCCCTCCCTTCCCTCCAAAAACTCACCCTCTCCCCCCTCAACCCCTCCGCCACCACCTCCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811071.1
MKVRSWLSTCSSATCIATSDAAAPSPPLTLFPPPKSLFSDTSSSSYSDNSQTNSSIQSNLSLLTLPSLPSLQKLTLSPLNPSATTSAAALLPLRGRAHVHFLALHNRLLYAALGDQIHVYETLTNTLLDTFNAASDATGAAKSIAFRGGRILTAHQDCKIRVWKLNDQKKHKLVATLPTLEDRLRRFILPQNYVRVRRHKQRLWIQHHDAVSGLAAIDDHRREVNLIASISWDRSIKIWNTRNLNCLQSINKAHDDAINA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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