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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004309`

染色体: Chr05 坐标: 56784626-56787751 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004309`
名称	SmilChr05G004309
描述	protein NRT1/ PTR FAMILY 2.13-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	56784626 - 56787751 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026170`
GeneID	`131026170`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026170`
原始查询	`SmilChr05G004309`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein NRT1/ PTR FAMILY 2.13-like
产物	protein NRT1/ PTR FAMILY 2.13-like
Arabidopsis	`AT1G69870` (NRT1.7) nitrate transporter 1.7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843323] identity=54.4; qcov=0.519; evalue=9.01e-174; confidence=medium
Rice	`Os01g0913300` (OsNRT1.7) - identity=51.8; qcov=0.515; evalue=1.88e-159; confidence=medium
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0022857 (transmembrane transporter activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00098 (zf-CCHC); PF00854 (PTR2); PF14223 (Retrotran_gag_2); PF22936 (Pol_BBD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026170

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057811922.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057811922.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811922.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811922.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811922.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:56784676`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B126
`Chr5:56784676`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B126
`Chr5:56784781`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,C8
`Chr5:56784783`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B78,B95,C12,C52
`Chr5:56784801`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B132,C56
`Chr5:56784833`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C19,C66
`Chr5:56784898`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,B70
`Chr5:56785076`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	A7
`Chr5:56785076`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A7
`Chr5:56785085`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,A8,B92,C30,C53
`Chr5:56785090`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr5:56785096`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B57,C56

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811922.1

850 aa

425

850

PTR2

Retrotran_gag_2

zf-CCHC

Pol_BBD

PF00854 PTR2 3-410 aa PF14223 Retrotran_gag_2 485-617 aa PF00098 zf-CCHC 676-691 aa PF22936 Pol_BBD 743-821 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811922.1`	Pfam	`PF00854`	PTR2	Family	3	410	7.4e-78	262.9	POT family
`XP_057811922.1`	Pfam	`PF14223`	Retrotran_gag_2	Domain	485	617	7.7e-14	52.5	gag-polypeptide of LTR copia-type
`XP_057811922.1`	Pfam	`PF00098`	zf-CCHC	Domain	676	691	0.00014	22.5	Zinc knuckle
`XP_057811922.1`	Pfam	`PF22936`	Pol_BBD	Domain	743	821	8.6e-24	84.4	Pol polyprotein, beta-barrel domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955939.1
TATTGAACTAGTGCGCGCATGCAGGGCATGGTGACGTTGACCATAATAGCAGGGGTGCCTCAGTTGCGGCCTCCGCCATGCATTAATCAAAAATGCAGCGCTCCCACCAAATCCCAGCTGGGAGTCCTGGCGCTGGGCCTCGGCTTTCTCTCCGTCGGCACCGGCGGCATCAGGCCGTGCAACATCCCTTTTGGCGTCGACCAGTTCGACGTCTCCACGGCGGAAGGGAGGAGAGGAATCAACAGCTTCTTCAACTGGTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026170
ATGCAGGGCATGGTGACGTTGACCATAATAGCAGGGGTGCCTCAGTTGCGGCCTCCGCCATGCATTAATCAAAAATGCAGCGCTCCCACCAAATCCCAGCTGGGAGTCCTGGCGCTGGGCCTCGGCTTTCTCTCCGTCGGCACCGGCGGCATCAGGCCGTGCAACATCCCTTTTGGCGTCGACCAGTTCGACGTCTCCACGGCGGAAGGGAGGAGAGGAATCAACAGCTTCTTCAACTGGTATTACATGTCCTTCACCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811922.1
MQGMVTLTIIAGVPQLRPPPCINQKCSAPTKSQLGVLALGLGFLSVGTGGIRPCNIPFGVDQFDVSTAEGRRGINSFFNWYYMSFTLVMTIALTLVVYIQDSVSWVWGFGFPTALMLFAIVLFFVGTNFYVYVVPEGSVFTAIAQVIAATYNKRKLHIPDAAAYFDPPLKGMLVTKLSLTNNLRFFNKAALITEGDIGVDGSNSNPWRLCSVQKVEETKCLFKIIPIWASGIICFTAIVQQSTFILSQALTMDRHLGPNF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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