当前解析结果
SmilChr05G004321| 统一新 Gene ID | SmilChr05G004321 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G004321 |
| 描述 | regulator of G-protein signaling 1 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 56860020 - 56864033 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131025373 |
|---|---|
| GeneID | 131025373 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131025373 |
| 原始查询 | SmilChr05G004321 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | regulator of G-protein signaling 1 |
| 产物 | regulator of G-protein signaling 1 |
| Arabidopsis | AT3G26090 (RGS1)REGULATOR OF G-PROTEIN SIGNALING 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822207] identity=58.8; qcov=0.983; evalue=0; confidence=high |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00615 (RGS) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131025373 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 1.00000 | XP_057811090.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057811090.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057811090.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057811090.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057811090.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:56860547 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C85 |
Chr5:56860548 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A3 |
Chr5:56860772 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A4,B126,B29,B72,B78 |
Chr5:56861101 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B7 |
Chr5:56861107 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C16,C81 |
Chr5:56861110 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B96 |
Chr5:56861178 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B135,B56,B60,B96 |
Chr5:56861190 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B135,B56,B60,B96 |
Chr5:56861221 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B52 |
Chr5:56861980 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B19,C10,C63 |
Chr5:56862908 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C81 |
Chr5:56862936 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A10,B102 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057811090.1PF00615
RGS 295-410 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057811090.1 |
Pfam | PF00615 |
RGS | Domain | 295 | 410 | 3.7e-12 | 47.4 | Regulator of G protein signaling domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。