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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004323`

染色体: Chr05 坐标: 56874476-56876551 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004323`
名称	SmilChr05G004323
描述	small heat shock protein, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	56874476 - 56876551 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025375`
GeneID	`131025375`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025375`
原始查询	`SmilChr05G004323`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	small heat shock protein, chloroplastic-like
产物	small heat shock protein%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT4G27670` (HSP21) heat shock protein 21 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828881] identity=40.3; qcov=1.01; evalue=1.27e-46; confidence=medium
Rice	`Os03g0245800` (OsHSP26) - identity=37.4; qcov=0.939; evalue=4.38e-35; confidence=medium
GO	GO:0009408 (response to heat)
KEGG	smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00011 (HSP20); PF17886 (ArsA_HSP20)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025375

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057811093.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057811093.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811093.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811093.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811093.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:56874781`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	17	B108,B109,B119,B123,B16,B44,B48,B71,B77,B80,B83,B88,B96,C10,C26,C37,D7
`Chr5:56874783`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	78	A1,A13,A15,A18,A24,A7,B1,B101,B102,B106,B107,B111,B112,B114,B118,B121,B126,B127,B13,B132,B137,B138,B139,B14,B140,B16,B17,B2,B23,B24,B28,B29,B33,B35,B47,B5,B58,B63,B67,B68,B71,B78,B79,B80,B82,B83,B84,B87,B89,B93,B99,C18,C19,C27,C32,C34,C40,C43,C48,C49,C50,C51,C55,C56,C6,C60,C62,C68,C71,C72,C73,C74,C75,C8,C80,C82,D1,D10
`Chr5:56874793`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,B63,B83,C40
`Chr5:56874797`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,B65,B77
`Chr5:56874820`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4
`Chr5:56874856`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B98,C54,C9
`Chr5:56874983`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33
`Chr5:56876183`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr5:56876234`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B130,B66,C11,C69
`Chr5:56876243`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A25,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811093.1

228 aa

114

228

HSP20

ArsA_HSP20

PF00011 HSP20 128-227 aa PF17886 ArsA_HSP20 134-212 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811093.1`	Pfam	`PF00011`	HSP20	Domain	128	227	2.4e-24	86.1	Hsp20/alpha crystallin family
`XP_057811093.1`	Pfam	`PF17886`	ArsA_HSP20	Domain	134	212	4.1e-08	33.4	HSP20-like domain found in ArsA

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955110.1
AAAACAATAAAATAAAAAACCGAAAATGAGATTTTTCAGAAAACGACATGAAAACAGAGTAGGTTGTTATGGAACCTTCTTCAACCTCCGGCCAGCTTCTGGAGAAGTCCAGTAAAATCCGACGCTTCCAGAATCGCCGCAGCTTCCCTTTAAATCTACACCCCAAATCTTTCTCTCTCTCTCACTAAAAACCTCAAGAATCATCAAGCAAACACCTTTTGCAAAGAGAGATGTCACACTGTTTATCCCAAACAGCTCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025375
ATGTCACACTGTTTATCCCAAACAGCTCTTTACACTCCCATTCCTCCGAGTTCAAGATTTTCCTATCTCCGGAAATCTCCCATCTCCGGCCGAAATTGTGCCAAGATTGCGGTCAGGGCCGCGGCGGCGGACGGCCGGGAGAATCTCGATCATTTGCAAAAGCAAAATAAGCAGCCGCAGCAGCCGCCGGCGGCCAAGAGAAGGGCCGCCCCTGCGGCCCCAATTGGTTTATGGGACAGATTTCCAACAGCTAGGACAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811093.1
MSHCLSQTALYTPIPPSSRFSYLRKSPISGRNCAKIAVRAAAADGRENLDHLQKQNKQPQQPPAAKRRAAPAAPIGLWDRFPTARTVQQMMETMERMMDDPLAYSGGWAPASPPAEAAGYGRGRTPWEIKEGESEYKLRFDMPGMTKEDVKVWVEEKMLVVKAEKKGGNGEGEGEEWPAKSYGRYSSRIALPENVEFEKIKAEVKDGVLYITIPKASSSAKVFDISVN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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