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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004331`

染色体: Chr05 坐标: 57011018-57013672 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004331`
名称	SmilChr05G004331
描述	vinorine synthase-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	57011018 - 57013672 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026175`
GeneID	`131026175`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026175`
原始查询	`SmilChr05G004331`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	vinorine synthase-like
产物	vinorine synthase-like
Arabidopsis	`AT1G24430` (AT1G24430) HXXXD-type acyl-transferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839059] identity=36.7; qcov=0.758; evalue=4.61e-36; confidence=medium
Rice	`Os04g0500700` (OsHCT1) hydroxycinnamoyltransferase 1-like [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:4336306] identity=28.4; qcov=0.635; evalue=1.61e-16; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02458 (Transferase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026175

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057811929.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057811929.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811929.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811929.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811929.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:57011050`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B94,D2
`Chr5:57011067`	`TCC`	`*`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B29,B86
`Chr5:57011090`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr5:57011095`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	A25,B108
`Chr5:57011095`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	2	A25,B108
`Chr5:57011104`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	A25,B108
`Chr5:57011104`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	2	A25,B108
`Chr5:57011131`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B127,B70
`Chr5:57011138`	`AT`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B86
`Chr5:57011156`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	80	A2,A20,A3,A7,B101,B102,B108,B110,B111,B12,B120,B123,B126,B127,B128,B132,B133,B134,B135,B18,B19,B22,B23,B25,B30,B33,B38,B39,B4,B41,B49,B51,B52,B53,B56,B59,B6,B60,B64,B65,B66,B71,B73,B74,B75,B83,B85,B96,C12,C13,C14,C16,C17,C23,C24,C29,C34,C35,C38,C42,C47,C5,C51,C52,C54,C57,C60,C61,C62,C63,C67,C76,C78,C79,C81,C84,C86,C9,D7,D9
`Chr5:57011165`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	166	A10,A16,A2,A20,A23,A25,A3,A4,A6,A7,A8,A9,B100,B101,B102,B103,B105,B108,B110,B111,B115,B117,B118,B12,B120,B123,B126,B127,B128,B129,B13,B131,B132,B133,B134,B135,B137,B138,B139,B14,B140,B15,B16,B17,B18,B19,B2,B22,B23,B24,B25,B27,B3,B30,B31,B32,B33,B35,B36,B38,B39,B4,B41,B45,B46,B47,B48,B49,B5,B51,B52,B53,B55,B56,B59,B6,B60,B62,B64,B65,B66,B68,B71,B73,B74,B75,B77,B79,B80,B82,B83,B84,B85,B88,B90,B91,B94,B96,B99,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C2,C22,C23,C24,C26,C29,C30,C31,C32,C33,C34,C35,C36,C38,C4,C40,C42,C45,C47,C48,C5,C50,C51,C52,C53,C54,C55,C56,C57,C6,C60,C61,C62,C63,C64,C65,C66,C67,C68,C69,C7,C70,C71,C74,C75,C76,C77,C78,C79,C80,C81,C84,C86,C87,C9,D10,D2,D3,D6,D7,D9
`Chr5:57011167`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	A15,C33,C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811929.1

277 aa

138

277

Transferase

PF02458 Transferase 1-160 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811929.1`	Pfam	`PF02458`	Transferase	Family	1	160	2.8e-22	79.7	Transferase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955946.1
ATGGCTGTTCGAGCCACCTATTTCCGCTGCGGCGGCGTCGCCGTCGGGATCCGCATATCGCACAAGATCGCCGACGGATTAACTTTCATCTCGTTCGTCAACACTTGGTCCGCCGTCGCCATAGGCAACGGCGGCGCCGTTGCGGCTCTCCTGAAGTTCGACGCCGCCGCCTATTTTCCGCCGCTGGACATCCTCGGCAGCCACGGACCCACTATAGGAGTGGTGGATGAAGAGGTCGCCGCCAGAGTCTTCACGTTCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026175
ATGGCTGTTCGAGCCACCTATTTCCGCTGCGGCGGCGTCGCCGTCGGGATCCGCATATCGCACAAGATCGCCGACGGATTAACTTTCATCTCGTTCGTCAACACTTGGTCCGCCGTCGCCATAGGCAACGGCGGCGCCGTTGCGGCTCTCCTGAAGTTCGACGCCGCCGCCTATTTTCCGCCGCTGGACATCCTCGGCAGCCACGGACCCACTATAGGAGTGGTGGATGAAGAGGTCGCCGCCAGAGTCTTCACGTTCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811929.1
MAVRATYFRCGGVAVGIRISHKIADGLTFISFVNTWSAVAIGNGGAVAALLKFDAAAYFPPLDILGSHGPTIGVVDEEVAARVFTFPASQIAALRERYTGPGGHRPSRVESLSAFIWTRFTSATGIGSDPGKNCVVYNAVNLRSRAKPPLSEYHFGNVIGATRREVVAGDDGVEFLRKLREATEALDADYVAGLKDREMQLEVLMDFARVNKMEVEVAARDGSVELLRKLHEASEAVDAGHVARMKNSEVSFLRNGFRVG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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