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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004334`

染色体: Chr05 坐标: 57024693-57028242 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004334`
名称	SmilChr05G004334
描述	trihelix transcription factor GT-4-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	57024693 - 57028242 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025384`
GeneID	`131025384`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025384`
原始查询	`SmilChr05G004334`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	trihelix transcription factor GT-4-like
产物	trihelix transcription factor GT-4-like
Arabidopsis	`AT1G13450` (GT-1) Homeodomain-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837905] identity=67.9; qcov=0.854; evalue=2.45e-165; confidence=high
Rice	`Os04g0486400` (rml1) - identity=60.9; qcov=0.879; evalue=4.88e-140; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13837 (Myb_DNA-bind_4); PF26214 (Ubiquitin_GT-1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025384

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811101.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811101.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811101.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811101.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057811101.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:57025038`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C15,C17
`Chr5:57025074`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B20,B40,B98,C50,C60
`Chr5:57025076`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr5:57025129`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr5:57025200`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,C71,D7
`Chr5:57026545`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B25,C18,C7,D10
`Chr5:57027708`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B83,B88
`Chr5:57027748`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:57027880`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B111,B132,B82,C56
`Chr5:57027895`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B111,B132,B82,C56
`Chr5:57027904`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr5:57027934`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B129,B50,C28

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811101.1

390 aa

195

390

Myb_DNA-bind_4

Ubiquitin_GT-1

PF13837 Myb_DNA-bind_4 70-157 aa PF26214 Ubiquitin_GT-1 258-318 aa PF26214 Ubiquitin_GT-1 323-388 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811101.1`	Pfam	`PF13837`	Myb_DNA-bind_4	Domain	70	157	2e-21	76.9	Myb/SANT-like DNA-binding domain
`XP_057811101.1`	Pfam	`PF26214`	Ubiquitin_GT-1	Domain	258	318	1.1e-46	157.2	GT-1-like, ubiquitin-like domain
`XP_057811101.1`	Pfam	`PF26214`	Ubiquitin_GT-1	Domain	323	388	1.1e-46	157.2	GT-1-like, ubiquitin-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955118.1
ATATTTTATTACTCTCTTCTCTTATTTTTTGAGGTTTATGTAACACACACACACACACACACAAAATCAAATTCTTCTCCGAAAATGGAGGAAAACCTAGAAGCTGATAATACGATCCCAACTCTGTGTGAAGAACCTAAGTGGAGTCTTGTCAATTTGTCATAATATAAACTCCTCCAAATTGTGAAAATCCCAAATCTTAAAATCGTCGAAGTTGTCTTTCAAAATCTGATCTTGACTGAAAACAAGAAACATGTACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025384
ATGTACATGTCCGAGAAACCCCAGCAGCAAGAATCCGCCATCGATTTCTACAACGGCGGCGGAAAACAAGAAGCTGGGCCGCTCCAGAACAGCAACATGATCATCCAGCTCCCCGACGGCGGCGGTGCGGCGCCCGAGGACGCCGCCGCAGCCCACAATCCAGCCCACCACGCCTCATCCTCGGCGGCGCCGAAGAAGCGGGCCGAGACGTGGGTGCAGGAGGAGACGAGGGCTCTCATCTCCCTCCGCAAAGAGATAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811101.1
MYMSEKPQQQESAIDFYNGGGKQEAGPLQNSNMIIQLPDGGGAAPEDAAAAHNPAHHASSSAAPKKRAETWVQEETRALISLRKEIDMLFNTSKSNKHLWDNISLKMREKGFDRSPTMCTDKWRNLLKEFKKTKQNNRDGNGNGSAKMSYYKEIEEILRERSRDGPNWKTSEAANTAGPPKVDSFMQFADKGIDDASLTFGPVEANGRSTLNLERRLDHEGHPLAITAADAVGASGVSPWNWRETPGSGEQTNTYDGRVI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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