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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004342`

染色体: Chr05 坐标: 57064177-57067797 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004342`
名称	SmilChr05G004342
描述	uncharacterized protein At3g61260-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	57064177 - 57067797 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025391`
GeneID	`131025391`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025391`
原始查询	`SmilChr05G004342`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Remorin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843080]; symbol=AT1G67590; hit=AT1G67590; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Remorin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843080]; symbol=AT1G67590; hit=AT1G67590; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G67590` (AT1G67590) Remorin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843080] identity=47.6; qcov=0.991; evalue=7.58e-96; confidence=high
Rice	`Os03g0120200` (OsREM6.2) - identity=35; qcov=0.991; evalue=7.04e-44; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03763 (Remorin_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025391

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057811110.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057811110.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811110.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811110.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811110.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:57066324`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B83,B88,C84
`Chr5:57066361`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,B63,B83,C40
`Chr5:57066366`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr5:57066495`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr5:57066504`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,C4
`Chr5:57066507`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,C4
`Chr5:57066517`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B16,B48,B77
`Chr5:57066542`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr5:57066570`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	A13,B63,B83,C40
`Chr5:57066570`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	4	A13,B63,B83,C40
`Chr5:57066766`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,C4
`Chr5:57066823`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811110.1

352 aa

176

352

Remorin_C

PF03763 Remorin_C 239-341 aa

XP_057811111.1

352 aa

176

352

Remorin_C

PF03763 Remorin_C 239-341 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811110.1`	Pfam	`PF03763`	Remorin_C	Family	239	341	1.7e-27	96.0	Remorin, C-terminal region
`XP_057811111.1`	Pfam	`PF03763`	Remorin_C	Family	239	341	1.7e-27	96.0	Remorin, C-terminal region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955128.1
GCTGGGGCAACGCTGGGGCTAGTCACAGCAGCAGTAGGCCATTTCATATTCAACACTGGCGAACGAGCTTGATGATGCTCGATTCCAATCTCATTTAGTCGAGCCCTTCAAGACGACGACCACTGCTCAACCAACGCAGATTTTGGTGACTAATCAAGAAGTGAGAGACATGAGATCCATAGAGGACAAAGGGTGTTTAAACAGTTGCCCCACAGAGGAGAATGCAGGTGGTGGCAGTTGCATGATCTTCGACTTCAAGA...

XM_057955127.1
AATTTCACACTCAGAGTTTGTTGGTTTTAAGGTCTCTCTCTCTCTCTCTCAGACACACACATACACACACAAACTTGGCTTTTTTATTGAGTGGACTTGAAATGAAGTACATGGTTGTGTTTCTGGGATTTTGTTGAGTTGGTTAATATTTTGGTGACTAATCAAGAAGTGAGAGACATGAGATCCATAGAGGACAAAGGGTGTTTAAACAGTTGCCCCACAGAGGAGAATGCAGGTGGTGGCAGTTGCATGATCTTCGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131025391
ATGAGATCCATAGAGGACAAAGGGTGTTTAAACAGTTGCCCCACAGAGGAGAATGCAGGTGGTGGCAGTTGCATGATCTTCGACTTCAAGAAGGGCGGCGGCGGCGGCGGCGCGGTGAGCAGGCCGTCGCCTCACCACCGGTCGTCTCTGGGGAAACCGACGCCGTCGAAGTGGGACGATGCTCAAAAGTGGCTGGTGAATCTGTCGAGAGGTGAGAGGAATCAGGCCAAGGCCTCCCCGCGCGACTCGAACGCCGATGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057811110.1
MRSIEDKGCLNSCPTEENAGGGSCMIFDFKKGGGGGGAVSRPSPHHRSSLGKPTPSKWDDAQKWLVNLSRGERNQAKASPRDSNADDRHLIASSAWAGGDEGEGGGGSPPPASNGGDKYKNVECDESVWRGGSKGDSSPKSVVRAICLRDMGTEMTPIGSKEPSRAATPIRAMSPTKTSSDSAGSVSRDTGSIPTQRTEESGGINGPTSHMSREGPETNSVKVAEIKIDDNSRVLNPLEARAAAWEEAERAKYTARYKRE...

XP_057811111.1
MRSIEDKGCLNSCPTEENAGGGSCMIFDFKKGGGGGGAVSRPSPHHRSSLGKPTPSKWDDAQKWLVNLSRGERNQAKASPRDSNADDRHLIASSAWAGGDEGEGGGGSPPPASNGGDKYKNVECDESVWRGGSKGDSSPKSVVRAICLRDMGTEMTPIGSKEPSRAATPIRAMSPTKTSSDSAGSVSRDTGSIPTQRTEESGGINGPTSHMSREGPETNSVKVAEIKIDDNSRVLNPLEARAAAWEEAERAKYTARYKRE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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