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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004355`

染色体: Chr05 坐标: 57141474-57143510 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004355`
名称	SmilChr05G004355
描述	zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	57141474 - 57143510 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026178`
GeneID	`131026178`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026178`
原始查询	`SmilChr05G004355`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like
产物	zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like
Arabidopsis	`AT3G42170` (DAYSLEEPER) BED zinc finger and hAT dimerization domain-containing protein DAYSLEEPER [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3769417] identity=22; qcov=0.892; evalue=2.35e-32; confidence=weak
Rice	`Os10g0426100` - identity=25.9; qcov=1.07; evalue=2.61e-58; confidence=low
GO	GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF05699 (Dimer_Tnp_hAT); PF27039 (ZBED1_RNase-like_helical); PF27041 (ZBED1_RNase-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026178

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811932.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811932.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811932.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811932.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057811932.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:57141735`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B130,B28,B79
`Chr5:57141770`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr5:57141864`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B119,B3,B45,B47,D7
`Chr5:57141967`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B115,B5,C33,C55,C8
`Chr5:57142020`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:57142312`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	10	A15,B119,B58,B66,B69,B74,C12,C41,C50,C59
`Chr5:57142587`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr5:57143097`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B16,B48,D4
`Chr5:57143283`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B43
`Chr5:57143283`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B43
`Chr5:57143287`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B16,B48,B77,D4
`Chr5:57143392`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811932.1

678 aa

339

678

ZBED1_RNase-like

ZBED1_RNase-like_helical

Dimer_Tnp_hAT

PF27041 ZBED1_RNase-like 190-272 aa PF27039 ZBED1_RNase-like_helical 286-394 aa PF05699 Dimer_Tnp_hAT 563-632 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811932.1`	Pfam	`PF27041`	ZBED1_RNase-like	Domain	190	272	8.9e-16	58.5	ZBED1 RNase-like domain
`XP_057811932.1`	Pfam	`PF27039`	ZBED1_RNase-like_helical	Domain	286	394	1e-09	39.1	ZBED1 RNase-like helical domain
`XP_057811932.1`	Pfam	`PF05699`	Dimer_Tnp_hAT	Domain	563	632	4.2e-16	59.2	hAT family C-terminal dimerisation region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955949.1
ATGGCGAGTCAAGAAAGTTCGTCTCGCCGATCTGTATCCTCCGACAAGAGAGGCAAGAGGATGCTGGTGGAGGTGCCGCCACCGCCGCCGCCATGCCCCAACGATGACCTATTCGCGGCGCACTTCGAAAAGGTATTAGATCCGGTCGTCGGAGATCTCAAAGTGATCTGCAGTTACTGCGCGCGCCTCTTCAGATTTAGCGCAGACGAGAAGGAATTCGGTACGCTCAGAGATCATTTAAACAAAAAACATAGAAGCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026178
ATGGCGAGTCAAGAAAGTTCGTCTCGCCGATCTGTATCCTCCGACAAGAGAGGCAAGAGGATGCTGGTGGAGGTGCCGCCACCGCCGCCGCCATGCCCCAACGATGACCTATTCGCGGCGCACTTCGAAAAGGTATTAGATCCGGTCGTCGGAGATCTCAAAGTGATCTGCAGTTACTGCGCGCGCCTCTTCAGATTTAGCGCAGACGAGAAGGAATTCGGTACGCTCAGAGATCATTTAAACAAAAAACATAGAAGCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811932.1
MASQESSSRRSVSSDKRGKRMLVEVPPPPPPCPNDDLFAAHFEKVLDPVVGDLKVICSYCARLFRFSADEKEFGTLRDHLNKKHRSKIGNESETESEQSSEGSTGTDADVFAYTYKRARNMIAKLVCEGSLPFKFAESDSFENLMKCCNPLAKKVPQAELIHEIITIVRESLLVLIKDFVKMSNRVSICSDVWTNDCTWQFVRISCHWVDESWTIQKRLIAFKSLSEEYHSAAEISHEMHKSLQIYGLGPKVFSISFDNN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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