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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004359`

染色体: Chr05 坐标: 57164704-57167240 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004359`
名称	SmilChr05G004359
描述	signal peptidase complex subunit 1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	57164704 - 57167240 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025410`
GeneID	`131025410`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025410`
原始查询	`SmilChr05G004359`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	signal peptidase complex subunit 1-like
产物	signal peptidase complex subunit 1-like
Arabidopsis	`AT4G40042` (AT4G40042) Microsomal signal peptidase 12 kDa subunit (SPC12) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830166] identity=76; qcov=0.859; evalue=1.25e-42; confidence=medium
Rice	`Os12g0438900` - identity=61.5; qcov=1.04; evalue=9.63e-36; confidence=medium
GO	GO:0005787 (signal peptidase complex); GO:0005789 (endoplasmic reticulum membrane); GO:0006465 (GO:0006465); GO:0045047 (protein targeting to ER)
KEGG	smil03060 (Protein export - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF06645 (SPC12)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025410

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057811141.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057811141.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811141.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811141.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811141.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:57164977`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,C82,D11
`Chr5:57165124`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr5:57165135`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:57165151`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B33,B40,C63

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811141.1

92 aa

SPC12

PF06645 SPC12 1-70 aa

XP_057811142.1

92 aa

SPC12

PF06645 SPC12 1-70 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811141.1`	Pfam	`PF06645`	SPC12	Family	1	70	9.3e-31	106.5	Microsomal signal peptidase 12 kDa subunit (SPC12)
`XP_057811142.1`	Pfam	`PF06645`	SPC12	Family	1	70	9.3e-31	106.5	Microsomal signal peptidase 12 kDa subunit (SPC12)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955159.1
ATAATCAATCTTTTTAAAGAGGCTAAATAAATATGCAATAGCCCAATTCGAAGGCCCAACATTAATCCAGTTTAAATATAACTGCAGCTGCAGCTGCATCGTCTCTTCAAGACTTCAACTTCAAGTCAAAGTCGTTACATTCTCATTTTCTCCGACTCCATTTCTTCCACCTAGCGCCGCCTCGCGCTGCTCCTGGATCCGCCACCTCGCCGGAAGATATCCAGCCTCGTCACCGGCGACCGCCTCCACCGCCTCTCTCT...

XM_057955158.1
CAATCTTTTTAAAGAGGCTAAATAAATATGCAATAGCCCAATTCGAAGGCCCAACATTAATCCAGTTTAAATATAACTGCAGCTGCAGCTGCATCGTCTCTTCAAGACTTCAACTTCAAGTCAAAGTCGTTACATTCTCATTTTCTCCGATGGATTGGCAAGGGCAGAAGCTAGCAGAGCACCTGATGCAGGTGTTGTTGGTGTGTTTTGCTGTGGTGGCCTTCATCACGGGCTATGTGTTGGGGTCATTTCAGATGATG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131025410
ATGGATTGGCAAGGGCAGAAGCTAGCAGAGCACCTGATGCAGGTGTTGTTGGTGTGTTTTGCTGTGGTGGCCTTCATCACGGGCTATGTGTTGGGGTCATTTCAGATGATGATGCTGATCTATGCAGCTGGTGTGGTGTTGACGTCTCTGCTTACAGTTCCCAACTGGCCCTTGTTCAACCGCCACTCCCTCAATTGGTTAGACCCAAGTGAGGCTGAGAAGCACCCGAAGCCACAGCCTGCTAGTTCTGGCCCCAAGAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057811141.1
MDWQGQKLAEHLMQVLLVCFAVVAFITGYVLGSFQMMMLIYAAGVVLTSLLTVPNWPLFNRHSLNWLDPSEAEKHPKPQPASSGPKKKTSKK

XP_057811142.1
MDWQGQKLAEHLMQVLLVCFAVVAFITGYVLGSFQMMMLIYAAGVVLTSLLTVPNWPLFNRHSLNWLDPSEAEKHPKPQPASSGPKKKTSKK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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