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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000004`

染色体: Chr06 坐标: 134156-138232 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000004`
名称	SmilChr06G000004
描述	homeobox protein knotted-1-like LET12
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	134156 - 138232 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987543`
GeneID	`130987543`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987543`
原始查询	`SmilChr06G000004`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	homeobox protein knotted-1-like LET12
产物	homeobox protein knotted-1-like LET12
Arabidopsis	`AT5G25220` (KNAT3) homeobox protein knotted-1-like 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832593] identity=76.7; qcov=0.816; evalue=1.14e-169; confidence=high
Rice	`Os02g0182800` (HOS58) - identity=72.5; qcov=0.73; evalue=6.07e-141; confidence=high
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF00046 (Homeodomain); PF03789 (ELK); PF03790 (KNOX1); PF03791 (KNOX2); PF05920 (Homeobox_KN)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987543

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057767082.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767082.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767082.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057767082.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057767082.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:134715`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B58
`Chr6:135092`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	77	A11,A15,A18,A19,A5,A8,B101,B104,B110,B111,B121,B124,B125,B126,B128,B129,B13,B131,B140,B19,B21,B24,B26,B29,B37,B42,B46,B5,B51,B53,B54,B55,B60,B62,B66,B71,B72,B74,B76,B80,B81,B87,B9,B90,B91,B92,B99,C1,C12,C13,C18,C21,C23,C26,C31,C35,C38,C40,C42,C45,C49,C55,C57,C60,C61,C62,C7,C71,C74,C77,C79,C83,C84,D11,D2,D3,D5
`Chr6:135093`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	77	A11,A15,A18,A19,A5,A8,B101,B104,B110,B111,B121,B124,B125,B126,B128,B129,B13,B131,B140,B19,B21,B24,B26,B29,B37,B42,B46,B5,B51,B53,B54,B55,B60,B62,B66,B71,B72,B74,B76,B80,B81,B87,B9,B90,B91,B92,B99,C1,C12,C13,C18,C21,C23,C26,C31,C35,C38,C40,C42,C45,C49,C55,C57,C60,C61,C62,C7,C71,C74,C77,C79,C83,C84,D11,D2,D3,D5
`Chr6:135120`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	65	A11,A15,A18,A19,A5,A8,B101,B104,B111,B121,B124,B125,B126,B129,B131,B140,B19,B24,B26,B29,B37,B42,B46,B5,B51,B53,B60,B62,B66,B71,B72,B74,B80,B81,B87,B90,B91,B92,B99,C1,C12,C13,C18,C23,C26,C31,C38,C40,C42,C45,C49,C55,C57,C60,C61,C62,C7,C71,C74,C77,C79,C84,D2,D3,D5
`Chr6:135142`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B62,D3
`Chr6:135142`	`G`	`GC`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B62,D3
`Chr6:135147`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B62,B91,D3
`Chr6:135147`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B62,B91,D3
`Chr6:135155`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B62,D3
`Chr6:135155`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B62,D3
`Chr6:135160`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B62
`Chr6:135160`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B62

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767082.1

374 aa

187

374

KNOX1

KNOX2

ELK

Homeobox_KN

Homeodomain

PF03790 KNOX1 102-142 aa PF03791 KNOX2 158-207 aa PF03789 ELK 265-286 aa PF05920 Homeobox_KN 305-344 aa PF00046 Homeodomain 311-344 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767082.1`	Pfam	`PF03790`	KNOX1	Family	102	142	1.7e-18	66.8	KNOX1 domain
`XP_057767082.1`	Pfam	`PF03791`	KNOX2	Family	158	207	7.8e-16	58.1	KNOX2 domain
`XP_057767082.1`	Pfam	`PF03789`	ELK	Family	265	286	0.00011	22.7	ELK domain
`XP_057767082.1`	Pfam	`PF05920`	Homeobox_KN	Family	305	344	3.4e-19	69.1	Homeobox KN domain
`XP_057767082.1`	Pfam	`PF00046`	Homeodomain	Domain	311	344	5.9e-05	23.5	Homeodomain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911099.1
ATCCAATTAATTTTATTAAAGTTTGTAACATCACAAACTTTATAATTAGCCGTAGACGTCATATTTATAAATTAGTGATGTGAGTTGAATCTTGAATTACTTAAAAAAAATGAAAAAGAAGACATAGACATAGTATGGGCAATTGACCATTCTGCCCCTATGGAAGCAAAGAAATACTTGTCAAGATTTTTGTTTTAAGCAAAGGAAAAAAAAAAGCTCCCTCAACTTCATCGTCCATCCTCCTTTCCACACTTGGAGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987543
ATGGCCTTTCAGCAGGACCACCACCACCTCTCCCAAGAAATGCCCCTCCACCACCCCCACTACTCCGACCACCACCACCACCACCCCTCCGTCTTCCGCTCCATCCTCCCCGATCACCCCGACGACAAACCCCCCACCTCCACCTGGCTCAACACCTCCTCCCTCCACCACCAGTGGCTCCCCACCCAGAGTCAACCCAGCCCCCCCACCCCCACCGCCAACAGCGATCACCTCCAGGACAGCGGGGATAAGAGCAACGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767082.1
MAFQQDHHHLSQEMPLHHPHYSDHHHHHPSVFRSILPDHPDDKPPTSTWLNTSSLHHQWLPTQSQPSPPTPTANSDHLQDSGDKSNGSGTNTNTNWEREKCKADILTHPLYEQLLSAHVSCLRIATPVDQLPRIDAQLAQSQQVVAKYSVLGHAHHPLDDKDLDNFMTHYVLLLSSFKEQLQQHVRVHAMEAVMACWELEQSLQSLTGVAPGEGSGATMSDDDEDQADSETNVFDESLDGGDNMGFGPLVPSETERSLME...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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