当前解析结果
SmilChr06G000014| 统一新 Gene ID | SmilChr06G000014 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G000014 |
| 描述 | dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 4A-like |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 235464 - 292806 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130987571 |
|---|---|
| GeneID | 130987571 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130987571 |
| 原始查询 | SmilChr06G000014 |
| 来源 | GFF basic annotation; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 4A-like |
| 产物 | dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 4A-like |
| Arabidopsis | AT3G12587 (AT3G12587)Oligosaccaryltransferase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:6240849] identity=89.2; qcov=1; evalue=2.87e-18; confidence=low |
| Rice | Os07g0620500- identity=89.2; qcov=1; evalue=3.81e-19; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | smil00510 (N-Glycan biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00513 (Various types of N-glycan biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)) |
| Pfam | PF10215 (Ost4) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130987571 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast thylakoid | 类囊体 | 0.80000 | XP_057767133.1 |
| 2 | Chloroplast thylakoid membrane | 类囊体膜 | 0.60000 | XP_057767133.1 |
| 3 | Endocytic vesicle | Endocytic vesicle | 0.20000 | XP_057767133.1 |
| 4 | Secreted | 分泌到胞外 | 0.20000 | XP_057767133.1 |
| 5 | Chloroplast | 叶绿体 | 0.20000 | XP_057767133.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057767133.1PF10215
Ost4 1-31 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057767133.1 |
Pfam | PF10215 |
Ost4 | Family | 1 | 31 | 2.9e-14 | 53.4 | Oligosaccaryltransferase |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。