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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000018`

染色体: Chr06 坐标: 250254-253199 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000018`
名称	SmilChr06G000018
描述	DNA damage-binding protein cmr1
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	250254 - 253199 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987561`
GeneID	`130987561`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987561`
原始查询	`SmilChr06G000018`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA damage-binding protein cmr1
产物	DNA damage-binding protein cmr1
Arabidopsis	`AT1G80710` (DRS1) DROUGHT SENSITIVE 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844410] identity=47.7; qcov=1.06; evalue=4.46e-147; confidence=high
Rice	`Os08g0282500` (OsWD40-157) - identity=50; qcov=0.651; evalue=9.66e-107; confidence=high
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0005515 (protein binding); GO:0005634 (nucleus); GO:2000001 (regulation of DNA damage checkpoint)
KEGG	-
Pfam	PF00400 (WD40)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987561

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057767120.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767120.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767120.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057767120.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057767120.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:250468`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B33,B45,C62,D5
`Chr6:250811`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B106,B134,B47,C21
`Chr6:250854`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B110,B22,C75
`Chr6:250854`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B110,B22,C75
`Chr6:250859`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B63,C85,D6
`Chr6:250886`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B95,C40
`Chr6:251296`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B110,B22,C75
`Chr6:252092`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33
`Chr6:252491`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B106,B134,B47,C21
`Chr6:252509`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A1,B77
`Chr6:252581`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B63,C85,D6
`Chr6:252924`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B41,C28

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767120.1

496 aa

248

496

WD40

PF00400 WD40 322-356 aa PF00400 WD40 366-398 aa

XP_057767121.1

495 aa

248

495

WD40

PF00400 WD40 321-355 aa PF00400 WD40 365-397 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767120.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	322	356	1.2e-10	42.1	WD domain, G-beta repeat
`XP_057767120.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	366	398	1.2e-10	42.1	WD domain, G-beta repeat
`XP_057767121.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	321	355	1.2e-10	42.1	WD domain, G-beta repeat
`XP_057767121.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	365	397	1.2e-10	42.1	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911137.1
CTGAACAGAAATACGGACACGAACACGCCACGTCATCCTATTTCAGTTTCGCGCCAATTCGCAATCTCCCGCCTCGCCTGCTATTATATCCCACCGCCCACAGCCGCCGTGGCAGAAGCATTTGATATACTCCAATTTGCATAAAGCAACCGTCGGGAAAAGGAAAACCGTCGACTGATACTCCGTCGTTCTCTATGGGAAGCAAGGGTAAAATGACAGACTATGAGCGGCGGAGGCTGGAAAACATAAAGCGAAATGAC...

XM_057911138.1
AACAGAAATACGGACACGAACACGCCACGTCATCCTATTTCAGTTTCGCGCCAATTCGCAATCTCCCGCCTCGCCTGCTATTATATCCCACCGCCCACAGCCGCCGTGGCAGAAGCATTTGATATACTCCAATTTGCATAAAGCAACCGTCGGGAAAAGGAAAACCGTCGACTGATACTCCGTCGTTCTCTATGGGAAGCAAGGGTAAAATGACAGACTATGAGCGGCGGAGGCTGGAAAACATAAAGCGAAATGACGAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130987561
ATGGGAAGCAAGGGTAAAATGACAGACTATGAGCGGCGGAGGCTGGAAAACATAAAGCGAAATGACGAAATGCTGGCGGCGCTCAAGATCCGCTCGAAGCTCAACGACCTCTCCACCGCTTCCGCCAAACGCAGCAGCGGTGGGAGCAAGTCGTATAAACGTAGTCCAGCAAAGAAGCCCAAAACTGAAACTCCGGTAGTACTGCGCCGGTCGCTTAGGGCACGTGGGGTGCCGCCTGATGCTGCTACTGCGAATGGCCT...

LOC130987561
ATGGGAAGCAAGGGTAAAATGACAGACTATGAGCGGCGGAGGCTGGAAAACATAAAGCGAAATGACGAAATGCTGGCGGCGCTCAAGATCCGCTCGAAGCTCAACGACCTCTCCACCGCTTCCGCCAAACGCAGCAGCAGCGGTGGGAGCAAGTCGTATAAACGTAGTCCAGCAAAGAAGCCCAAAACTGAAACTCCGGTAGTACTGCGCCGGTCGCTTAGGGCACGTGGGGTGCCGCCTGATGCTGCTACTGCGAATGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057767120.1
MGSKGKMTDYERRRLENIKRNDEMLAALKIRSKLNDLSTASAKRSSSGGSKSYKRSPAKKPKTETPVVLRRSLRARGVPPDAATANGLDDDVDIEKQINKSQTMNSNSAPNVSPRKQGPIRMHDSYIGEDGLDNKLLELVKGCSREGLLNESGSVSYDSVDNIEGCKTSKIGKSSWGHVEELELKPENVARVVPGRIMSLRFFPTRDMQMVAVGNKFGDIGFWHVNGKEEDGDGIYLYHPHAGPVSGIVIDPFCISKMYS...

XP_057767121.1
MGSKGKMTDYERRRLENIKRNDEMLAALKIRSKLNDLSTASAKRSSGGSKSYKRSPAKKPKTETPVVLRRSLRARGVPPDAATANGLDDDVDIEKQINKSQTMNSNSAPNVSPRKQGPIRMHDSYIGEDGLDNKLLELVKGCSREGLLNESGSVSYDSVDNIEGCKTSKIGKSSWGHVEELELKPENVARVVPGRIMSLRFFPTRDMQMVAVGNKFGDIGFWHVNGKEEDGDGIYLYHPHAGPVSGIVIDPFCISKMYSS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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