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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000021`

染色体: Chr06 坐标: 261109-262558 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000021`
名称	SmilChr06G000021
描述	class V chitinase CHIT5-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	261109 - 262558 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987564`
GeneID	`130987564`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987564`
原始查询	`SmilChr06G000021`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	class V chitinase CHIT5-like
产物	class V chitinase CHIT5-like
Arabidopsis	`AT4G19810` (ChiC) Glycosyl hydrolase family protein with chitinase insertion domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827725] identity=37.2; qcov=1; evalue=1.77e-79; confidence=medium
Rice	`Os11g0462100` - identity=34.9; qcov=0.945; evalue=1.91e-57; confidence=low
GO	GO:0004568 (chitinase activity); GO:0005576 (extracellular region); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process); GO:0006032 (chitin catabolic process); GO:0008061 (chitin binding)
KEGG	smil00520 (Amino sugar and nucleotide sugar metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00704 (Glyco_hydro_18)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987564

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057767125.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057767125.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767125.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767125.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767125.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:261179`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B16,C23
`Chr6:261179`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B16,C23
`Chr6:261192`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B45,B75,D2
`Chr6:261195`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,C15
`Chr6:261208`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B130,B73
`Chr6:261208`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B130,B73
`Chr6:261233`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:261261`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,B58,C49,C80,D5
`Chr6:261264`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B136,C32,C68
`Chr6:261267`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:261271`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,D11
`Chr6:261304`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B115

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767125.1

382 aa

191

382

Glyco_hydro_18

PF00704 Glyco_hydro_18 39-365 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767125.1`	Pfam	`PF00704`	Glyco_hydro_18	Domain	39	365	8.1e-67	226.8	Glycosyl hydrolases family 18

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911142.1
ACACACACACATCTGTGGTGTGATTAGATCACTCCAATAACAGAAAACTAAAGCATGGCTAATCAAAAAATTCTCTCACTTTTCCTGGCTCTCATAATCACTCTCTACGAAGCTTCTCACGTTGCAGCTTCACCGTCTCTTCCTCAGCCGCGCCGCCGCGGCGTCAAAGCCGCATACTGGCCGTCGTGGCAGGCAGCGTCTCTCCCACCCTCAGCCATCCCAACCGCATACTTCACACACGTATTCTACGCCTTCGTCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987564
ATGGCTAATCAAAAAATTCTCTCACTTTTCCTGGCTCTCATAATCACTCTCTACGAAGCTTCTCACGTTGCAGCTTCACCGTCTCTTCCTCAGCCGCGCCGCCGCGGCGTCAAAGCCGCATACTGGCCGTCGTGGCAGGCAGCGTCTCTCCCACCCTCAGCCATCCCAACCGCATACTTCACACACGTATTCTACGCCTTCGTCCTCATCGACGCCAACACTTTCCAAATCTTAATCAATCAGAACGACGATCAATGGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767125.1
MANQKILSLFLALIITLYEASHVAASPSLPQPRRRGVKAAYWPSWQAASLPPSAIPTAYFTHVFYAFVLIDANTFQILINQNDDQWMQSFTSTLHASTPRAEAVLSIGGAGADPATFSAMASTSAGRATFIQSAVSAARRHGFDGLDLDWEFPGNVQDMSNLALLLKEWRSVVNGEAAASGKPRLLLSAAVYYSPDLSYPGPRSYPGRAVGRYLDILSPMCFDYHGGWEPNATAAHALLYDARSNVSTSYGVAAWKRGGA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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