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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000023`

染色体: Chr06 坐标: 265481-266796 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000023`
名称	SmilChr06G000023
描述	methyl-CpG-binding domain-containing protein 2-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	265481 - 266796 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987567`
GeneID	`130987567`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987567`
原始查询	`SmilChr06G000023`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	methyl-CpG-binding domain-containing protein 2-like
产物	methyl-CpG-binding domain-containing protein 2-like
Arabidopsis	`AT5G35330` (MBD02) methyl-CPG-binding domain protein 02 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833487] identity=53.3; qcov=0.856; evalue=2.51e-57; confidence=high
Rice	`Os09g0494300` - identity=56.1; qcov=0.759; evalue=3.22e-57; confidence=high
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF01429 (MBD); PF07496 (zf-CW)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987567

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057767130.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057767130.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767130.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767130.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057767130.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:265674`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	50	A1,A13,A18,A19,A20,A21,A22,A25,A3,A4,A5,A7,B107,B11,B118,B122,B128,B130,B140,B20,B3,B33,B51,B54,B61,B64,B66,B78,B8,B80,B87,B88,B98,C15,C16,C2,C32,C4,C40,C46,C5,C52,C58,C59,C60,C68,C74,C79,C83,D10
`Chr6:265684`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	83	A1,A11,A13,A14,A15,A18,A19,A20,A21,A22,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A7,B10,B104,B107,B11,B110,B113,B118,B122,B128,B130,B137,B140,B20,B22,B3,B32,B33,B37,B45,B46,B49,B51,B53,B54,B57,B6,B61,B64,B65,B66,B70,B78,B8,B80,B87,B88,B94,B98,C15,C16,C2,C21,C25,C32,C37,C4,C40,C42,C46,C5,C52,C54,C58,C59,C60,C61,C65,C67,C68,C71,C74,C75,C79,C83,C85,D10
`Chr6:265896`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr6:265990`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B73,C38,C47,C70
`Chr6:265990`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B73,C38,C47,C70
`Chr6:266272`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C71
`Chr6:266272`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C71
`Chr6:266298`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr6:266485`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B115,B133,B77,B79
`Chr6:266485`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B115,B133,B77,B79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767130.1

195 aa

195

zf-CW

MBD

PF07496 zf-CW 29-77 aa PF01429 MBD 94-162 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767130.1`	Pfam	`PF07496`	zf-CW	Domain	29	77	1.1e-06	29.2	CW-type Zinc Finger
`XP_057767130.1`	Pfam	`PF01429`	MBD	Domain	94	162	4.2e-14	52.6	Methyl-CpG binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911147.1
TAATTCAATACAATTCAATTTATGCATATGCTATTTTCTTCTTCCCTTTTGCCAGACCAAATATCATTACACATACTATGAAATTAAAGGCGTATTAATCTCGTTAATTATTACAATTCAATGTCTTTACAAATAACGCACAACCCTCTTTTGGGAAAAAAAAATAGTATAGAATACAACCCATAAATAAATACATGTATTTGCAAAATAATTTGTTTGAAGCAATGGAGGAAACAGATGGCGTGCAAGCGAAGAAGGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987567
ATGTATTTGCAAAATAATTTGTTTGAAGCAATGGAGGAAACAGATGGCGTGCAAGCGAAGAAGGTGTGGGAATCGGTGAAGCTGTATACAGTTAGGTGTGGGGTATGCTCAAAGTGGCGACTGATCCCCTCAAAACACAAATACGAGGAGATTAGGGCAAAATTGGGGGAAGAGATGTTTGAATGCGCGACAGCTCGAGAGTGGAGGCCGCAGATCTCATGCGCTCATGAGTCGGATGTGGAGCAGGACGACGGGAACTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767130.1
MYLQNNLFEAMEETDGVQAKKVWESVKLYTVRCGVCSKWRLIPSKHKYEEIRAKLGEEMFECATAREWRPQISCAHESDVEQDDGNFRWAMDKPNIPQTPPAWQRILRIRAEGGTKFADVYYVSPSNKRLRSMVELSRYLEENPRYEEDKIKVSHFSFQPPLPLDHKYVAKRQTRVQFASNTQNCGGKLEAPSQN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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