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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000027`

染色体: Chr06 坐标: 285922-290304 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000027`
名称	SmilChr06G000027
描述	two-component response regulator ARR12-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	285922 - 290304 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987558`
GeneID	`130987558`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987558`
原始查询	`SmilChr06G000027`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	two-component response regulator ARR12-like
产物	two-component response regulator ARR12-like
Arabidopsis	`AT2G25180` (RR12) response regulator 12 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817056] identity=41.7; qcov=1.02; evalue=1.14e-125; confidence=medium
Rice	`Os02g0796500` (ORR3) - identity=55.7; qcov=0.64; evalue=9.81e-135; confidence=high
GO	GO:0000160 (phosphorelay signal transduction system); GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0009736 (cytokinin-activated signaling pathway)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00072 (Response_reg); PF00249 (Myb_DNA-binding)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987558

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057767118.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767118.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767118.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057767118.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057767118.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:287939`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B122,B64,C12,C29
`Chr6:288227`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr6:288656`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B33,B81,C8
`Chr6:288682`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,B60
`Chr6:288811`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr6:288869`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	30	A15,A2,A21,B1,B104,B115,B124,B125,B13,B137,B140,B2,B28,B33,B48,B68,B71,B81,B90,B92,C16,C30,C33,C62,C71,C8,C80,C82,C87,D11
`Chr6:288935`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B139,B37,B93,C21,C35
`Chr6:288977`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B139,B37,B93,C21,C35
`Chr6:288980`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B139,B37,B93,C21,C35
`Chr6:288993`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B137
`Chr6:289081`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,A23,B10,C54,C85
`Chr6:289507`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B57,C25,C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767118.1

634 aa

317

634

Response_reg

Myb_DNA-binding

PF00072 Response_reg 19-128 aa PF00249 Myb_DNA-binding 200-250 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767118.1`	Pfam	`PF00072`	Response_reg	Domain	19	128	3.2e-25	89.2	Response regulator receiver domain
`XP_057767118.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	200	250	1.3e-07	32.4	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911135.1
CCATTCCACTACCAAATATTGCATGCTAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAGCAGAAAAAGTTGAAAGCAGCAGACTATAAACAAATCTCCATTATTCACATACACCGCACACAATCCTTATACATACATCTATGTCGATATTCTATAACATATACACCTATTCTCACAAATCACTGGTTTGAGAGAGAGAGAGACACGGGGGAAAAAAAGACAAACCAAATCTTCACTTACAGCGTTAGAAAAAGAAAAACAAAAAAAAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987558
ATGATTGTGGAAGAAATTAGGGGTGATGCCGAGAATTTCCCGGCGGGGATGCGTGTTCTTGCTGTTGATGATGACCCAACTTGCTTGATGTTATTGGAAACTTTACTCAGAAAATGCCACTATAATGTCACTACAACGAACCAGGCAAGGATTGCGTTGAAAATGATCAGGGAAAACAAAGACAGATTTGACTTGGTGATTAGTGATGTGCACATGCCGGACATGGATGGCTTTAAGCTTCTGGAACTTGTTGGTCTTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767118.1
MIVEEIRGDAENFPAGMRVLAVDDDPTCLMLLETLLRKCHYNVTTTNQARIALKMIRENKDRFDLVISDVHMPDMDGFKLLELVGLEMDLPVIMLSANSDPKLVMKGVTHGACDYLVKPIRIEELRNIWQHVIRRKKFDSKNQNRSSDLAKAHQASGEGHGSPLAGNTDQNAKFNRKRKDDEDEIEDNEYEDNGAQKKPRVVWTIELHRKFVTAVNQLGIEKAVPKRILDMMNVEGLSRENVASHLQKYRLYLKRISTVA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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