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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID,以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因,再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr06G000028

染色体: Chr06 坐标: 290243-292595 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr06G000028
名称SmilChr06G000028
描述uncharacterized SmilChr06G000028
染色体 / SeqIDChr06 / NC_080392.1
坐标与链方向290243 - 292595 / -

ID 对照

NCBI Gene IDLOC130987568
GeneID130987568
locus_tag-
NCBI NameLOC130987568
原始查询SmilChr06G000028

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述ubiquitin-associated protein (DUF1068) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816965]; symbol=AT2G24290; hit=AT2G24290; species=arabidopsis; confidence=high
产物ubiquitin-associated protein (DUF1068) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816965]; symbol=AT2G24290; hit=AT2G24290; species=arabidopsis; confidence=high
ArabidopsisAT2G24290 (AT2G24290)
ubiquitin-associated protein (DUF1068) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816965]
identity=60.1; qcov=1.01; evalue=5.56e-70; confidence=high
RiceOs04g0501800 (OSJNBa0029H02.27)
-
identity=50.6; qcov=1.02; evalue=1.16e-51; confidence=high
GO-
KEGG-
PfamPF06364 (DUF1068)
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:130987568

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Endoplasmic reticulum membrane 内质网膜 0.60000 XP_057767131.1
2 Endoplasmic reticulum 内质网 0.40000 XP_057767131.1
3 Golgi apparatus 高尔基体 0.40000 XP_057767131.1
4 Growth cone Growth cone 0.20000 XP_057767131.1
5 Nucleus 细胞核 0.00000 XP_057767131.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变,或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767131.1
167 aa
N
1
84
167
DUF1068
C
PF06364 DUF1068 5-167 aa
Protein ID 来源 结构域编号 结构域名称 类型 起始 aa 终止 aa E-value Score 说明
XP_057767131.1 Pfam PF06364 DUF1068 Family 5 167 4.1e-61 206.4 Protein of unknown function (DUF1068)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA(仅基因区域)

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA
XM_057911148.1
AAAAAGCAGCATTGAAATGAGGAGAGTCGCTGACATTCAGACAGACAATGGTGGGCTGGAAACATGAAATGCTTTTACTTACTGCACACCAACGTGATTACATAAATATAAAATGCCCAAAAAAAAACAAAAGAAGGAAGATTGATTGATCGATTAATTCCGCATCAGACGGTAGCACTAACAGCAGCTGCCATTATTAAAGAATTGAGTAAATTCAGTTGCTGCTGCTGCTGCTGGATGATTGTTTGAGAGAGATGAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA
LOC130987568
ATGAGTGGAAGATCAGTGAGGTGTGCGTTGGTGATTCTTGCTGTGATTTCATCGCTCTGCCTCTGTGGGCCGCTTCTGTATTTTAAGGTGAAGAAGGGTTTCAAGTCCAAGGAGGTTTCAGCTTCTTGTGCTCCATGCATTTGCCATTGCTCCCCTCCTCAATCGCTCTCACACATTGCTCCTGGCTTGGCTCATCTCACTGTTAAAGATTGTGGAAAACATGATCCTGATCTCAAGGAAGAGATGGAGAAGCATTATGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA
XP_057767131.1
MSGRSVRCALVILAVISSLCLCGPLLYFKVKKGFKSKEVSASCAPCICHCSPPQSLSHIAPGLAHLTVKDCGKHDPDLKEEMEKHYVDLLSEELRLHDAVGKEQSQHMNITLREARRSASEYRKEAEKCNVATETCEGARERAALLLTREKKITALWERRAKLLGWE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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