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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000039`

染色体: Chr06 坐标: 328633-334006 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000039`
名称	SmilChr06G000039
描述	AP2/ERF and B3 domain-containing transcription factor At1g51120-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	328633 - 334006 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987582`
GeneID	`130987582`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987582`
原始查询	`SmilChr06G000039`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AP2/ERF and B3 domain-containing transcription factor At1g51120-like
产物	AP2/ERF and B3 domain-containing transcription factor At1g51120-like
Arabidopsis	`AT1G51120` (AT1G51120) AP2/B3 transcription factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841535] identity=46.5; qcov=1; evalue=8.21e-89; confidence=high
Rice	`Os01g0693400` (AP2/EREBP#127) - identity=42.4; qcov=0.711; evalue=1.37e-48; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF02362 (B3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987582

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057767147.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767147.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767147.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057767147.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057767147.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:332935`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr6:333216`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C33,C78
`Chr6:333322`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,B33,B46,D7
`Chr6:333634`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B126
`Chr6:333769`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B94,C5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767147.1

325 aa

162

325

PF02362 B3 161-262 aa

XP_057767148.1

325 aa

162

325

PF02362 B3 161-262 aa

XP_057767149.1

325 aa

162

325

PF02362 B3 161-262 aa

XP_057767150.1

325 aa

162

325

PF02362 B3 161-262 aa

XP_057767151.1

325 aa

162

325

PF02362 B3 161-262 aa

XP_057767152.1

325 aa

162

325

PF02362 B3 161-262 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767147.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	161	262	9.8e-22	77.5	B3 DNA binding domain
`XP_057767148.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	161	262	9.8e-22	77.5	B3 DNA binding domain
`XP_057767149.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	161	262	9.8e-22	77.5	B3 DNA binding domain
`XP_057767150.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	161	262	9.8e-22	77.5	B3 DNA binding domain
`XP_057767151.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	161	262	9.8e-22	77.5	B3 DNA binding domain
`XP_057767152.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	161	262	9.8e-22	77.5	B3 DNA binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

6 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911166.1
GAGAGAGAGAGAGAGAGAGGTGAGAGCCGTAAATGTGCAAGATTACTTTGTTGAAAATGAAAAGTGGAAAGTACATTGTGTGTGATTGTTGACTAAAAAAAACCAACGCCCCAGAAAACCCTAATAATAATTGTTTCCAAACATTACTTTTTCCAAATGGTTTCTCAGATCTAAAACCATAGCCCAAGAAGAATGTGCAGTGTGTGTGGTGGTGCAGCTGTGTTTAGTGAGGAGAAGGAGAGGGAGATTGATTGCAGAGT...

XM_057911169.1
AGAGAGAGAGAGGTGAGAGCCGTAAATGTGCAAGATTACTTTGTTGAAAATGAAAAGTGGAAAGTACATTGTGTGTGATTGTTGACTAAAAAAAACCAACGCCCCAGAAAACCCTAATAATAATTGTTTCCAAACATTACTTTTTCCAAATGGTTTCTCAGATCTAAAACCATAGCCCAAGAAGAATGTGCAGTGTGTGTGGTGGTGCAGCTGTGTTTAGTGAGGAGAAGGAGAGGGAGATTGATTGCAGAGTGACAGAA...

CDS

6 records

下载 CDS FASTA

LOC130987582
ATGATGGAAGAAGCAAGTGGTGCTACGAAAAACCTGTGGGGTGAAATTTCTGATTCCAGCAGCAGCAGTCATCACCAGATTCCCACAAGGCATCAAACGAGCACCGCGGGGGCCGGGGCCCCCGCGTCGAGATTCAAAGGCGTGGTGTCCCAACCAAACGGCCACTGGGGCGCGCAGATATACGCCAACCACCAGCGCATTTGGCTCGGGACTTTCAAATCGGAGAAGGATGCAGCAATGGCGTACGACAGTGCTGCGAT...

Protein

6 records

下载 Protein FASTA

XP_057767147.1
MMEEASGATKNLWGEISDSSSSSHHQIPTRHQTSTAGAGAPASRFKGVVSQPNGHWGAQIYANHQRIWLGTFKSEKDAAMAYDSAAMKLRNGLTSRNFPWTDATVREPSFQEQFSTETVLTMIKDGSYASKFSDYTRDQDRHGPRVTALHDAPATRLRLLFEKELTPSDVSKLNRLVIPKKFAVKYFPRISHATGGKGGGSVDDIELLFFDRSMRSWNFRYCYWKSSQSFVFTRGWNRFAKEKGLRSKDRVIFSSYESSG...

XP_057767148.1
MMEEASGATKNLWGEISDSSSSSHHQIPTRHQTSTAGAGAPASRFKGVVSQPNGHWGAQIYANHQRIWLGTFKSEKDAAMAYDSAAMKLRNGLTSRNFPWTDATVREPSFQEQFSTETVLTMIKDGSYASKFSDYTRDQDRHGPRVTALHDAPATRLRLLFEKELTPSDVSKLNRLVIPKKFAVKYFPRISHATGGKGGGSVDDIELLFFDRSMRSWNFRYCYWKSSQSFVFTRGWNRFAKEKGLRSKDRVIFSSYESSG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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