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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000049`

染色体: Chr06 坐标: 402855-407013 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000049`
名称	SmilChr06G000049
描述	omega-6 fatty acid desaturase, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	402855 - 407013 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987593`
GeneID	`130987593`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987593`
原始查询	`SmilChr06G000049`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	omega-6 fatty acid desaturase, chloroplastic
产物	omega-6 fatty acid desaturase%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT4G30950` (FAD6) fatty acid desaturase 6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829220] identity=74.3; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0440900` - identity=83.7; qcov=0.414; evalue=1.33e-117; confidence=low
GO	GO:0006629 (lipid metabolic process); GO:0016491 (oxidoreductase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00487 (FA_desaturase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987593

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057767164.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057767164.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767164.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767164.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767164.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:403900`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B102,B54,C42
`Chr6:404057`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr6:404074`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr6:404706`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B15
`Chr6:404706`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B15
`Chr6:405551`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C13
`Chr6:406447`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr6:406699`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767164.1

444 aa

222

444

FA_desaturase

PF00487 FA_desaturase 145-392 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767164.1`	Pfam	`PF00487`	FA_desaturase	Domain	145	392	3.2e-33	116.3	Fatty acid desaturase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911181.1
CTAATTTGAAGCCATGCATCTTTGACAAAGTAGAGCCCTAATTAACATTTTGGATTGTGGGAATGAGTGGCAATGAAAAAGCAGTGTACAAATTGACAGCAGACTGATGGCTGTGGATTATGATTGGGTGGATTCCGGTCCCAAACAAATTCTAACCAACTGTGTTGTGTGCTACTCTTCAACTATCACTATATAAACCCCTCACCATAACATCCTTAGATTCAGGCCCCATTTTCAACTCTTTGCTAGAATCCTATCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987593
ATGGCGTGTAGACTTGCACATTCTGGCTTCCTTATCTTGGGGCACCAGAAAAGGCCAAATGAGAGCAACAGAATTTTTGCTCAGAGCTCTACTTCATCAGGTTCATATCTTCTGAAGTGGGAAAGTCTGCCTCAGAGATTAAGCAAACGAAAACAATGCTTTAAATCGCTGCAAAAGCGTGAAATTGTGAGAGCTGTGGCTGTCAATGTGGCACCTTCCCCAGCAGCAGACAGTGCAGAATATAGACAGCGGTTGTGTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767164.1
MACRLAHSGFLILGHQKRPNESNRIFAQSSTSSGSYLLKWESLPQRLSKRKQCFKSLQKREIVRAVAVNVAPSPAADSAEYRQRLCHEYGFRQIGEPLPDSVTLRDIIDTLPKKVFEIDDAKALKSVLVSVTSYALGIFMIAKAPWYLLPLAWAWTGTAITGFFVIGHDCAHKSFSRNKLVEDIVGTLAFMPLIYPYEPWRFKHDRHHAKTNMLEEDTAWLPVKPEEFESSSILRKAIIYGYGPLRPWMSIAHWLIMHFD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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