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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000056`

染色体: Chr06 坐标: 447171-452585 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000056`
名称	SmilChr06G000056
描述	probable WRKY transcription factor 32
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	447171 - 452585 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987601`
GeneID	`130987601`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987601`
原始查询	`SmilChr06G000056`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable WRKY transcription factor 32
产物	probable WRKY transcription factor 32
Arabidopsis	`AT4G30935` (WRKY32) WRKY DNA-binding protein 32 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829218] identity=53.2; qcov=0.677; evalue=2.52e-107; confidence=high
Rice	`Os01g0826400` (OsWRKY24) - identity=42.3; qcov=0.506; evalue=1.44e-52; confidence=medium
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF03106 (WRKY)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987601

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057767170.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767170.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767170.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057767170.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057767170.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:447307`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,B140
`Chr6:447345`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr6:447483`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B57,B65
`Chr6:447552`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B137
`Chr6:447728`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr6:447748`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B118,B52,B59,C39,C70
`Chr6:447750`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B133
`Chr6:447756`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C29,C37
`Chr6:447766`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr6:449009`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B20,B54,B70,C18
`Chr6:449357`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D11
`Chr6:449421`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767170.1

490 aa

245

490

WRKY

PF03106 WRKY 186-241 aa PF03106 WRKY 358-414 aa

XP_057767171.1

486 aa

243

486

WRKY

PF03106 WRKY 182-237 aa PF03106 WRKY 354-410 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767170.1`	Pfam	`PF03106`	WRKY	Domain	186	241	1.1e-43	148.0	WRKY DNA -binding domain
`XP_057767170.1`	Pfam	`PF03106`	WRKY	Domain	358	414	1.1e-43	148.0	WRKY DNA -binding domain
`XP_057767171.1`	Pfam	`PF03106`	WRKY	Domain	182	237	1e-43	148.1	WRKY DNA -binding domain
`XP_057767171.1`	Pfam	`PF03106`	WRKY	Domain	354	410	1e-43	148.1	WRKY DNA -binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911187.1
AAAAACGGTTCTTCAAAAAGAATTGTGGAAAAGAAGAGCTTTTTATTACCTGTTGAGAGTCGCAAAAGCACGCACCTCACACACTGACTCTGTGTGGGAATCCGCCATGGAAGGAGCGAATAATCGGAGCTCCGACGCTCTTCGGGAGAAGGTGAGCGAGGATTCGGAGCCGTCGGAGGAGAGAGGAGTGGAGAATCGAGACGGAAAAGCTGAGAAAATTGATGAACAGAGTCGAGTGAGCAGTGGTAGCACCAGTGATT...

XM_057911188.1
AAAAACGGTTCTTCAAAAAGAATTGTGGAAAAGAAGAGCTTTTTATTACCTGTTGAGAGTCGCAAAAGCACGCACCTCACACACTGACTCTGTGTGGGAATCCGCCATGGAAGGAGCGAATAATCGGAGCTCCGACGCTCTTCGGGAGAAGGTGAGCGAGGATTCGGAGCCGTCGGAGGAGAGAGGAGTGGAGAATCGAGACGGAAAAGCTGAGAAAATTGATGAACAGAGTCGAGTGAGCAGTGGTAGCACCAGTGATT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130987601
ATGGAAGGAGCGAATAATCGGAGCTCCGACGCTCTTCGGGAGAAGGTGAGCGAGGATTCGGAGCCGTCGGAGGAGAGAGGAGTGGAGAATCGAGACGGAAAAGCTGAGAAAATTGATGAACAGAGTCGAGTGAGCAGTGGTAGCACCAGTGATTATGCACTCGGGAACAGTTCTAGAGGAGAATCGAAAGCTTCTCAATTACAAACCCTAGCCTCTGTCGAGCTGCCCGTCGCTGATTTCCGAGCCGATTTTGATGATTC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057767170.1
MEGANNRSSDALREKVSEDSEPSEERGVENRDGKAEKIDEQSRVSSGSTSDYALGNSSRGESKASQLQTLASVELPVADFRADFDDSSDHLSEVPVEYSLQPVPSGEDMKFLPQDHVKSVKKIVPKDIGGKSSASATKSSSSIASSNPPEQKLRPVENGSNLCIPEQDKQNPKRLSIVPTPRTPSDGYNWRKYGQKQVKSPEGSRSYYRCTFSDCCAKKIECCDISNRLIETVYRSHHNHDPPQKLNSTRENKPSLSSPP...

XP_057767171.1
MEGANNRSSDALREKVSEDSEPSEERGVENRDGKAEKIDEQSRVSSGSTSDYALGNSSRGESKASQLQTLASVELPVADFRADFDDSSDHLSEVPVEYSLQPVPSGEDMKDHVKSVKKIVPKDIGGKSSASATKSSSSIASSNPPEQKLRPVENGSNLCIPEQDKQNPKRLSIVPTPRTPSDGYNWRKYGQKQVKSPEGSRSYYRCTFSDCCAKKIECCDISNRLIETVYRSHHNHDPPQKLNSTRENKPSLSSPPVNGS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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