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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000061`

染色体: Chr06 坐标: 501325-505747 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000061`
名称	SmilChr06G000061
描述	transmembrane 9 superfamily member 9-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	501325 - 505747 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987605`
GeneID	`130987605`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987605`
原始查询	`SmilChr06G000061`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transmembrane 9 superfamily member 9-like
产物	transmembrane 9 superfamily member 9-like
Arabidopsis	`AT5G25100` (AT5G25100) Endomembrane protein 70 protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832581] identity=81.4; qcov=0.98; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0554900` - identity=81.3; qcov=0.958; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0072657 (protein localization to membrane)
KEGG	-
Pfam	PF02990 (EMP70)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987605

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057767177.1`
2	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.40000	`XP_057767177.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.40000	`XP_057767177.1`
4	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.40000	`XP_057767177.1`
5	Endosome	内体	0.40000	`XP_057767177.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:503593`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D3
`Chr6:503593`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr6:503615`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B111,B4,C51
`Chr6:503646`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr6:503817`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,C24
`Chr6:504224`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B111,B4,C51
`Chr6:504545`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:504584`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr6:504718`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B37
`Chr6:504718`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B37
`Chr6:504974`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,B10,B32
`Chr6:505058`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767177.1

641 aa

320

641

EMP70

PF02990 EMP70 60-597 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767177.1`	Pfam	`PF02990`	EMP70	Family	60	597	3.7e-224	745.8	Endomembrane protein 70

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911194.1
AAGACCTCCGAGGTGGGTAATACACGCTATAATTAATAAACTAGCTATATGATTAATTAAGATAAATCTCAGTCAAAATTTCCATTCTAATTAATTAGTCTGAACTAAGCTCACCCTCAGATCTCAATCTAACGGCTCTGATCGCATCTTCAACCCAAAGTGTAACTCCGCCCTTTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCCTCAGTTGGATTCTCTCTTTGCTTCGAGTTTCATCCTCGTGCTTGCCGTGCCATTCAATCCTCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987605
ATGGGGCCGGAGAGGAGAAAGCCTCACGCGGTTTCGATGTGGATGTGCTTCGCGCTCCTCCTCCTCGTCAACGCCGTCCACTCCTTCTACCTTCCCGGCGTCGCTCCTCAGGATTTTGAGAAGGGTGATCTTCTGAAGGTGAAAGTGAATAAATTGGCCTCTGTAAAAACTCAACTGCCTTATGCTTACTATTCCCTTCCTTACTGTAAACCAAAGAAAATTGAGGACAGTGCTGAGAATCTTGGGGAAATCCTTCGTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767177.1
MGPERRKPHAVSMWMCFALLLLVNAVHSFYLPGVAPQDFEKGDLLKVKVNKLASVKTQLPYAYYSLPYCKPKKIEDSAENLGEILRGDRIENSPYEFKMREPQMCNVVCRVTLSDKEVKEFKEKIDDEYRVNMILDNLPLVVPFRRPDTDALVYQHGYPVGFKAQYAGSKEERYFIYNHLAFTVKFHKDEETDAARIVGFEAKHFSIKHGYDGKWDDSKTRLTTCDPHAKRTVTNSNTPHVVDDKEIIFTYDVEFQESEV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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