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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000062`

染色体: Chr06 坐标: 505950-513476 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000062`
名称	SmilChr06G000062
描述	probable cyclic nucleotide-gated ion channel 5
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	505950 - 513476 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987604`
GeneID	`130987604`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987604`
原始查询	`SmilChr06G000062`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable cyclic nucleotide-gated ion channel 5
产物	probable cyclic nucleotide-gated ion channel 5
Arabidopsis	`AT5G57940` (CNGC5) cyclic nucleotide gated channel 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835905] identity=78.2; qcov=0.985; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0646300` (OsCNGC6) - identity=61.8; qcov=0.958; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005249 (voltage-gated potassium channel activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0006813 (potassium ion transport); GO:0016020 (membrane); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	smil04626 (Plant-pathogen interaction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00027 (cNMP_binding); PF00520 (Ion_trans)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987604

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057767175.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767175.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767175.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767175.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057767175.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:506154`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr6:506196`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr6:506199`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,C83,D11
`Chr6:506231`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C31
`Chr6:506367`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24
`Chr6:506463`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24
`Chr6:506910`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr6:510188`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,B107
`Chr6:511441`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C34
`Chr6:511458`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C70
`Chr6:511798`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767175.1

737 aa

368

737

Ion_trans

cNMP_binding

PF00520 Ion_trans 114-435 aa PF00027 cNMP_binding 530-620 aa

XP_057767176.1

737 aa

368

737

Ion_trans

cNMP_binding

PF00520 Ion_trans 114-435 aa PF00027 cNMP_binding 530-620 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767175.1`	Pfam	`PF00520`	Ion_trans	Family	114	435	1.1e-22	81.1	Ion transport protein
`XP_057767175.1`	Pfam	`PF00027`	cNMP_binding	Domain	530	620	1.3e-08	35.4	Cyclic nucleotide-binding domain
`XP_057767176.1`	Pfam	`PF00520`	Ion_trans	Family	114	435	1.1e-22	81.1	Ion transport protein
`XP_057767176.1`	Pfam	`PF00027`	cNMP_binding	Domain	530	620	1.3e-08	35.4	Cyclic nucleotide-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911192.1
AGAAGAGGGAAAAATACAAGGACGTATGCGTCATTTTCCAAATTGTGCTCCCCCACTTCCTGCATTACTTCCTTGGATAAATTTTGACTTCACCTCTGGAATCTCTCTCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCATGTTGCTGGAAGAAACGCGAATTGATGGCGTGATATATGTGGAATTTTGCTTAAAATTTCATTTAATCATACAAAATGTTTGATTGTGGTCCAAAGACTCAATACATCACTGGGCAGCGGGACAAGT...

XM_057911193.1
TCATTTTCCAAATTGTGCTCCCCCACTTCCTGCATTACTTCCTTGGATAAATTTTGACTTCACCTCTGGAATCTCTCTCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCATGTTGCTGGAAGAAACGCGAATTGATGGCGTGATATATGTGGAATTTTGCTTTGCAGTTGTGTTCTGCAATATCCTGAAGTTTTGAATTAGGAATGATTGCAGAGCTGACTTTATGCTGAAGATGGATTTACAGCTGTAGTCGATTTATCATTTTTG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130987604
ATGTTTGATTGTGGTCCAAAGACTCAATACATCACTGGGCAGCGGGACAAGTTTGTAAGATTGGATGACTTGGATTCCAGACTCTCATCCCCATCTACTTCAGTTGCTACAAACAAATGTGGCTTGAGTATCGAGGGTTTGGGCCGTGGTAATCATAGAAATCCTGCTCCATCAAAATCCTTTAAGAGAGGAATGAAGAAAGGATCTCAAGGTCTAAAATCTATTGGTCGGTCCCTTGGTTTTGGTGTCTCGCGAGCAGT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057767175.1
MFDCGPKTQYITGQRDKFVRLDDLDSRLSSPSTSVATNKCGLSIEGLGRGNHRNPAPSKSFKRGMKKGSQGLKSIGRSLGFGVSRAVFPEDLKVSEKRIFDPQDKLLTLWNKLFVMSCILGVSVDPLFFFLPVFNKSSNCLDIDRKLAITATTLRTIVDAFYLIHMVLQFRTAYIAPSSRVFGRGELVIDPGQIAKRYLKCYFIIDFLAVLPLPQIVVWRFLQRSNGSDVLATKQALFFIILLQYIPRFTRIMPLTSELK...

XP_057767176.1
MFDCGPKTQYITGQRDKFVRLDDLDSRLSSPSTSVATNKCGLSIEGLGRGNHRNPAPSKSFKRGMKKGSQGLKSIGRSLGFGVSRAVFPEDLKVSEKRIFDPQDKLLTLWNKLFVMSCILGVSVDPLFFFLPVFNKSSNCLDIDRKLAITATTLRTIVDAFYLIHMVLQFRTAYIAPSSRVFGRGELVIDPGQIAKRYLKCYFIIDFLAVLPLPQIVVWRFLQRSNGSDVLATKQALFFIILLQYIPRFTRIMPLTSELK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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