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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000066`

染色体: Chr06 坐标: 524136-527149 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000066`
名称	SmilChr06G000066
描述	AP2-like ethylene-responsive transcription factor At1g16060
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	524136 - 527149 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987610`
GeneID	`130987610`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987610`
原始查询	`SmilChr06G000066`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AP2-like ethylene-responsive transcription factor At1g16060
产物	AP2-like ethylene-responsive transcription factor At1g16060
Arabidopsis	`AT1G16060` (ADAP) ARIA-interacting double AP2 domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838176] identity=77.2; qcov=0.613; evalue=8.86e-106; confidence=high
Rice	`Os09g0423800` (AP2/EREBP#153) - identity=63.5; qcov=0.946; evalue=2.83e-126; confidence=high
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF00847 (AP2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987610

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057767184.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767184.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767184.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057767184.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057767184.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:524487`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A9
`Chr6:524487`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A9
`Chr6:524564`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr6:524591`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr6:524620`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr6:524623`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr6:524696`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,B36,C19,C34,C49
`Chr6:524700`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr6:524759`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,C86
`Chr6:525385`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B4,C86
`Chr6:525385`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B4,C86
`Chr6:525527`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B49,B60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767184.1

351 aa

176

351

AP2

PF00847 AP2 49-106 aa PF00847 AP2 149-200 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767184.1`	Pfam	`PF00847`	AP2	Domain	49	106	3.2e-21	76.1	AP2 domain
`XP_057767184.1`	Pfam	`PF00847`	AP2	Domain	149	200	3.2e-21	76.1	AP2 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911201.1
TTTCTTCATATATACACCCATTATTATTATTATTATTTTCTGTAATTTTCATGGCCAAATTATCACTGCACCAGAATTCTAACAGCAACACTACTAGTTCAAATGTTGTCAATGGCGCCAATCCTGTCGCAATGAAGCCCAAACGCACGAGGAAAACTATTCCTCGAGACTCCCCTCCTAAGCGCAGCTCCATCTATCGGGGCGTAACGAGGCATCGTTGGACTGGTCGATATGAAGCACATTTGTGGGACAAAAATTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987610
ATGGCCAAATTATCACTGCACCAGAATTCTAACAGCAACACTACTAGTTCAAATGTTGTCAATGGCGCCAATCCTGTCGCAATGAAGCCCAAACGCACGAGGAAAACTATTCCTCGAGACTCCCCTCCTAAGCGCAGCTCCATCTATCGGGGCGTAACGAGGCATCGTTGGACTGGTCGATATGAAGCACATTTGTGGGACAAAAATTGTTGGAACGAGTCGCAGAATAAGAAGGGAAGACAAGTCTATCTTGGTGCATA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767184.1
MAKLSLHQNSNSNTTSSNVVNGANPVAMKPKRTRKTIPRDSPPKRSSIYRGVTRHRWTGRYEAHLWDKNCWNESQNKKGRQVYLGAYDDEGAAARSYDLAALKYWGRDTILNFPVSTYEKEITEMGRQSKEEYIGSLRRKSSGFSRGVSKYRGVARHHHNGRWEARIGRVFGNKYLYLGTYATQEEAAIAYDMAAIEYRGLNAVTNFDLSRYIKWLKPSTAAAAAASTSTNPNSDITDANIGSCSSIHDRGTLPPLHQPP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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