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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000074`

染色体: Chr06 坐标: 560830-564245 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000074`
名称	SmilChr06G000074
描述	uncharacterized SmilChr06G000074
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	560830 - 564245 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987618`
GeneID	`130987618`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987618`
原始查询	`SmilChr06G000074`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	P0528B09.47-1; symbol=P0528B09.47-1; hit=Os08g0442300; species=rice; confidence=high
产物	P0528B09.47-1; symbol=P0528B09.47-1; hit=Os08g0442300; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G18430` (AT3G18430) Calcium-binding EF-hand family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821372] identity=70.9; qcov=1; evalue=5.31e-92; confidence=high
Rice	`Os08g0442300` (P0528B09.47-1) - identity=77.1; qcov=1; evalue=6.01e-99; confidence=high
GO	GO:0005509 (calcium ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00036 (EF-hand_1); PF13405 (EF-hand_6); PF13499 (EF-hand_7)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987618

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057767198.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057767198.1`
3	Cell projection	细胞突起	0.20000	`XP_057767198.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767198.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767198.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:561066`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr6:561404`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,B47,C63,D10
`Chr6:562127`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B44,C5,C79,C85,D9
`Chr6:562320`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr6:563558`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,B46,C61

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767198.1

175 aa

175

EF-hand_7

EF-hand_1

EF-hand_6

PF13499 EF-hand_7 31-119 aa PF00036 EF-hand_1 96-122 aa PF13405 EF-hand_6 97-122 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767198.1`	Pfam	`PF13499`	EF-hand_7	Domain	31	119	5.7e-14	52.9	EF-hand domain pair
`XP_057767198.1`	Pfam	`PF00036`	EF-hand_1	Domain	96	122	1.3e-10	40.8	EF hand domain
`XP_057767198.1`	Pfam	`PF13405`	EF-hand_6	Domain	97	122	2.6e-11	42.9	EF-hand domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911215.1
AAAAGAAAAATAAAACGTTAATTCCTATGTCCCAATATGTATAAATATTTTTTTTTTCTTTTGGAAGAAAACCTTCATATTAGTTGGGTTGGTGGGCAAAAACACAAACATATTGCAGGCACTCCAATTTAAGCTCTAAATCCACTACCCCAACTTCTTGATCCGCCATTTTTTTGGAAATCAAGCTTCTACTTTTACCTCCACACCTGATTTCTTCTCGTTCTAGGATTCCGGGCACAAGAATTTATCATGGGCAACGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987618
ATGGGCAACGGCTCCTCCATGCTCACTCAGTACGACATTGAAGAGGTCCAAGAACACTGCAGCAACACCTTTTCCCAGCAGGAGATAGTTTCACTGTACCAGAGGTTCTGCCAGCTGGACAGGAGCGGAGGCGGCTTCATCTCCGCCGACGAGTTTATGACTGTACCAGAATTTGCAGTCAATCCCCTCTCTCAGAGATTGTTAAGGATGCTGGATGGGCTAAATTTCAAGGAGTTTGTATTATTCCTATCTGCTTTTAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767198.1
MGNGSSMLTQYDIEEVQEHCSNTFSQQEIVSLYQRFCQLDRSGGGFISADEFMTVPEFAVNPLSQRLLRMLDGLNFKEFVLFLSAFSSRASLQLKVEFIFKVYDSDGNGKVSFNDILDILRDLTGQFIAEHQREHVLTQVLEEAGYTKNSLLVPADFMKILGSSELKMEVEVPVD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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