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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000079`

染色体: Chr06 坐标: 590206-593385 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000079`
名称	SmilChr06G000079
描述	translation initiation factor IF3-4, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	590206 - 593385 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987623`
GeneID	`130987623`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987623`
原始查询	`SmilChr06G000079`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	translation initiation factor IF3-4, chloroplastic
产物	translation initiation factor IF3-4%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT4G30690` (AT4G30690) Translation initiation factor 3 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829192] identity=60.3; qcov=1.01; evalue=9.44e-91; confidence=high
Rice	`Os02g0794400` - identity=60.9; qcov=0.713; evalue=3.34e-71; confidence=high
GO	GO:0003743 (translation initiation factor activity); GO:0006413 (translational initiation); GO:0032790 (ribosome disassembly); GO:0043022 (ribosome binding)
KEGG	-
Pfam	PF00707 (IF3_C); PF05198 (IF3_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987623

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057767204.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.20000	`XP_057767204.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767204.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767204.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767204.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:590496`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B36,B99,C15
`Chr6:590612`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B138,B34,B65,C36,C70
`Chr6:591284`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr6:591741`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,B54,B57,B98,C26
`Chr6:593015`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C29

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767204.1

265 aa

132

265

IF3_N

IF3_C

PF05198 IF3_N 80-145 aa PF00707 IF3_C 155-238 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767204.1`	Pfam	`PF05198`	IF3_N	Domain	80	145	7.7e-26	90.8	Translation initiation factor IF-3, N-terminal domain
`XP_057767204.1`	Pfam	`PF00707`	IF3_C	Domain	155	238	3.2e-22	79.0	Translation initiation factor IF-3, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911221.1
TTCGACCTTGCTAAAAAACATAATCAAAAGTGACTTGGAAAAATCCCTCCAAATTTCTCTGGATAAGATAATAATCAGCTGCTGCATGTCTTGGGCTTAAAACTTCTTCACAACCCCCCCTACCCCCAACCCAACCCAACCCCACCCCGCCATGGCTGGTCTGACCAGCACCTTCCACCATCCCTGCAAATCCCAGCTGCCCAAAACCTTCAAACCCTTTTCCATCCACCTCCACACCTTTTCCCTCCGCATCCTCACCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987623
ATGGCTGGTCTGACCAGCACCTTCCACCATCCCTGCAAATCCCAGCTGCCCAAAACCTTCAAACCCTTTTCCATCCACCTCCACACCTTTTCCCTCCGCATCCTCACCCCAAAAACCGCCCGCTGCCCCTCAATTTCCACCACTATCTCCGCCCGCTACGGCGGCGGTGGAGGCGGCAGCGGCGGCTCGCAGCGGAGGTCCAAGCCCAGTGAGGATGAAGCCCTAGACTTCTCTACGGTTAAGTCAGATACTGTTAGGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767204.1
MAGLTSTFHHPCKSQLPKTFKPFSIHLHTFSLRILTPKTARCPSISTTISARYGGGGGGSGGSQRRSKPSEDEALDFSTVKSDTVRLIDQQQKMVGVVTKAQAFQMAEDAELDLVILSPDAEPPVVRIMDYNKYKYEQQKKKRDQQKKSLATRMDMKELKMGYNIDVHDYSVRLKAAKRFLANGDKVKIIVNLKGRENEFRNNAIELVRRFQADVGELATEEAKSFKDRNIFIVLVPNKVVVQKSQEPPPKKKDDAVANE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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