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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000082`

染色体: Chr06 坐标: 608833-611841 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000082`
名称	SmilChr06G000082
描述	nucleoid-associated protein At4g30620, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	608833 - 611841 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987628`
GeneID	`130987628`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987628`
原始查询	`SmilChr06G000082`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nucleoid-associated protein At4g30620, chloroplastic-like
产物	nucleoid-associated protein At4g30620%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT2G24020` (AT2G24020) Putative BCR, YbaB family COG0718 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816936] identity=62.4; qcov=1; evalue=3.14e-72; confidence=high
Rice	`Os02g0180200` - identity=60.6; qcov=1; evalue=5.94e-73; confidence=high
GO	GO:0003677 (DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF02575 (YbaB_DNA_bd)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987628

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057767209.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057767209.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767209.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767209.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767209.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:608986`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B112,B118,B70,C16,C78
`Chr6:610322`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D11
`Chr6:610409`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr6:610753`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B37,C48,C51
`Chr6:611447`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:611646`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	105	A11,A20,A22,A25,A5,A7,A8,B100,B102,B103,B105,B109,B11,B112,B114,B115,B117,B118,B119,B12,B121,B123,B125,B127,B132,B133,B18,B19,B20,B23,B29,B35,B37,B40,B45,B48,B49,B50,B51,B52,B53,B57,B59,B60,B62,B63,B69,B70,B77,B79,B81,B83,B85,B87,B88,B89,B90,B92,B97,B98,B99,C1,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C2,C20,C24,C25,C27,C28,C29,C30,C32,C33,C34,C35,C40,C42,C43,C46,C50,C53,C55,C56,C57,C60,C62,C65,C68,C69,C72,C73,C77,C78,C79,C80,C81,C87,D1,D3,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767209.1

188 aa

188

YbaB_DNA_bd

PF02575 YbaB_DNA_bd 81-175 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767209.1`	Pfam	`PF02575`	YbaB_DNA_bd	Domain	81	175	2.4e-16	60.3	YbaB/EbfC DNA-binding family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911226.1
AAAGGATAATTATTTATGCGTAAAATTTGTAAACAGCAACCAACAACCTAACTACTTTATCCACTCATCTCTTTCACCTCCGAGTGCGTGTTTTCTGTGTGAACAATGGCGTCAACCAGTGCGCTCACATCTCCACTTGCCAAGTCTATGCCGCTTTCTGGCTCCATATACAGATTAAACACCAGCTCAAGTCCAGTTGGCATTTGTGTTCTATCTCAGTCTACTTACCAGAAGTTGATAGTGAAACAGAAACCTCTTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987628
ATGGCGTCAACCAGTGCGCTCACATCTCCACTTGCCAAGTCTATGCCGCTTTCTGGCTCCATATACAGATTAAACACCAGCTCAAGTCCAGTTGGCATTTGTGTTCTATCTCAGTCTACTTACCAGAAGTTGATAGTGAAACAGAAACCTCTTCAAATTTGCTGCCTATTTGGTGGTAAGAAAGATGATGGTGAAAAGAGCGATGATGCTCCTTCAAAGGCGGGAATCATGGGAGGAATGCAAGGGTTATATGAAACAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767209.1
MASTSALTSPLAKSMPLSGSIYRLNTSSSPVGICVLSQSTYQKLIVKQKPLQICCLFGGKKDDGEKSDDAPSKAGIMGGMQGLYETVKKAQMVVQVEAVKVQKELALAEFEGYCEGELIKVTLSGNQQPIRTEITEAAMELGAEKLSLLINEAYKDAHQKSVLAMKDRMSGLAQSLGMPPGLTEGFKQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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