Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000090`

染色体: Chr06 坐标: 649695-652211 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000090`
名称	SmilChr06G000090
描述	uncharacterized SmilChr06G000090
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	649695 - 652211 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987635`
GeneID	`130987635`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987635`
原始查询	`SmilChr06G000090`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828917]; symbol=AT4G28025; hit=AT4G28025; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828917]; symbol=AT4G28025; hit=AT4G28025; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G28025` (AT4G28025) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828917] identity=58.3; qcov=0.939; evalue=2.16e-45; confidence=medium
Rice	`Os02g0610700` (OJ1476_F05.21-1) - identity=51.9; qcov=0.885; evalue=3.63e-32; confidence=medium
GO	GO:0009535 (chloroplast thylakoid membrane)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987635

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057767215.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057767215.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.40000	`XP_057767215.1`
4	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.40000	`XP_057767216.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767216.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:649903`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr6:649904`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr6:650086`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:650399`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B75,C20
`Chr6:650479`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C12

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911233.1
ACAAAGAGATGGAGTATCTCTTGAAAATAAGTCAAAAATAAAATAAAATCCAAAGTTGCAAGTATTCAAAGAATCAAATTGTACGGATGTGACGAAGCCTCGAAATCGAAATAAGCTATCCAAAGTGTTTGAGTGGATCACAAAATCCCAACGCTGTCGAAAACTCGAATCTTTCCATTAACAGCTTAACACCATCAATATTCAGCTTCACACACAGCTCGAATTTCAATGGTGTCATCCGCGACGGCGCCCTTCGCTAA...

XM_057911232.1
ACAAAGAGATGGAGTATCTCTTGAAAATAAGTCAAAAATAAAATAAAATCCAAAGTTGCAAGTATTCAAAGAATCAAATTGTACGGATGTGACGAAGCCTCGAAATCGAAATAAGCTATCCAAAGTGTTTGAGTGGATCACAAAATCCCAACGCTGTCGAAAACTCGAATCTTTCCATTAACAGCTTAACACCATCAATATTCAGCTTCACACACAGCTCGAATTTCAATGGTGTCATCCGCGACGGCGCCCTTCGCTAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130987635
ATGGTGTCATCCGCGACGGCGCCCTTCGCTAATGGCGGAGTCCTCTTATCATCAGCACCTCGATTATCTGCCGCTAATTCTCATTCCTCTGCTGCTTTCAAGTGGGGACTGCAAAGAGAGCAAAATGTGCGGTTGTTTCCTCGAAGAATAACGGGTCAAGCGATTCGTGTCTTGGCAAATCCAAATGCATCTTCAGGGAAAGGAAAAGCGAAAAAAGAAGTAGTTATGGTCGATCCTTTGGAAGCCAAAAGATTAGCAAC...

LOC130987635
ATGGTGTCATCCGCGACGGCGCCCTTCGCTAATGGCGGAGTCCTCTTATCATCAGCACCTCGATTATCTGCCGCTAATTCTCATTCCTCTGCTGCTTTCAACTGCCCGCTCTCTTCTAGGTGGGGACTGCAAAGAGAGCAAAATGTGCGGTTGTTTCCTCGAAGAATAACGGGTCAAGCGATTCGTGTCTTGGCAAATCCAAATGCATCTTCAGGGAAAGGAAAAGCGAAAAAAGAAGTAGTTATGGTCGATCCTTTGGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057767215.1
MVSSATAPFANGGVLLSSAPRLSAANSHSSAAFNCPLSSRWGLQREQNVRLFPRRITGQAIRVLANPNASSGKGKAKKEVVMVDPLEAKRLATKQMELIKAKEKFKRRRQIEAINGAWAMVGLTAGLVIEGHTGKSILAQLSGYWDAVVGLIVR

XP_057767216.1
MVSSATAPFANGGVLLSSAPRLSAANSHSSAAFKWGLQREQNVRLFPRRITGQAIRVLANPNASSGKGKAKKEVVMVDPLEAKRLATKQMELIKAKEKFKRRRQIEAINGAWAMVGLTAGLVIEGHTGKSILAQLSGYWDAVVGLIVR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

JBrowse

跳转到基因组浏览器