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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000105`

染色体: Chr06 坐标: 748739-752519 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000105`
名称	SmilChr06G000105
描述	eukaryotic translation initiation factor 2 subunit gamma-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	748739 - 752519 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987652`
GeneID	`130987652`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987652`
原始查询	`SmilChr06G000105`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	eukaryotic translation initiation factor 2 subunit gamma-like
产物	eukaryotic translation initiation factor 2 subunit gamma-like
Arabidopsis	`AT1G04170` (EIF2 GAMMA) eukaryotic translation initiation factor 2 gamma subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839238] identity=87.8; qcov=0.994; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0607100` - identity=91.2; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000049 (tRNA binding); GO:0001731 (formation of translation preinitiation complex); GO:0003743 (translation initiation factor activity); GO:0003924 (GTPase activity); GO:0005525 (GTP binding); GO:0005829 (cytosol); GO:0005850 (eukaryotic translation initiation factor 2 complex); GO:0045903 (positive regulation of translational fidelity)
KEGG	-
Pfam	PF00009 (GTP_EFTU); PF03144 (GTP_EFTU_D2); PF09173 (eIF2_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987652

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057767234.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057767234.1`
3	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057767234.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057767234.1`
5	Midbody	Midbody	0.60000	`XP_057767234.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:748931`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,C41
`Chr6:749075`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr6:749096`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr6:749138`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr6:749378`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B126
`Chr6:750091`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr6:750142`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,B108
`Chr6:750163`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B111,B73
`Chr6:751342`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,B51
`Chr6:751584`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:751608`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C40,C77
`Chr6:751614`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767234.1

464 aa

232

464

GTP_EFTU

GTP_EFTU_D2

eIF2_C

PF00009 GTP_EFTU 32-236 aa PF03144 GTP_EFTU_D2 268-350 aa PF09173 eIF2_C 362-451 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767234.1`	Pfam	`PF00009`	GTP_EFTU	Domain	32	236	1e-26	94.4	Elongation factor Tu GTP binding domain
`XP_057767234.1`	Pfam	`PF03144`	GTP_EFTU_D2	Domain	268	350	3.8e-08	34.3	Elongation factor Tu domain 2
`XP_057767234.1`	Pfam	`PF09173`	eIF2_C	Domain	362	451	7.3e-32	110.2	Initiation factor eIF2 gamma, C terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911251.1
GCAGCCCAATTGTTTAGTTAATTAAGCCCAATTCAATTCAAAACAAGGCCCAAACTTTCTCTCTCTTGATTTACCCACAGACCCCTCTCTCTGCTCATTCTTTCCCTTCACGCTAAAACACAGAAAACTTCCCAACTGCCGCCGCCTCCTTCTCCGGCGAGGATCTGCGCGGCGGACCGCCACTACTACCGCCGTCCGTCTCCCTTCACTGCTCTCTCGGCGGAGCAGCAGCAACTTTCTGCCGCCGCCCCGACTGCCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987652
ATGTTGAGGAAGGGCTTGATGGAGCAGGATTTAAGCAAGCTGGATGTAACAAAACTAAATCCACTGTCGCCTGAGGTTATTTCTCGCCAGGCCACCATCAACATTGGCACCATTGGGCATGTGGCTCATGGGAAGTCAACAGTTGTGAAGGCCATCTCTGGTGTCCAGACTGTTCGCTTTAAAAATGAACTGGAACGTAATATTACTATCAAACTTGGGTATGCCAATGCCAAGATATACAAGTGTGAAGAGGATCGATG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767234.1
MLRKGLMEQDLSKLDVTKLNPLSPEVISRQATINIGTIGHVAHGKSTVVKAISGVQTVRFKNELERNITIKLGYANAKIYKCEEDRCPRPMCYKAYGSGKEDSPMCDVPGFENCRMKLLRHVSFVDCPGHDILMATMLNGAAIMDGALLLIAANESCPQPQTSEHLAAVEIMRLQHIIILQNKVDLVQENVAINQHEAIQRFIQGTVADGAPVVPISAQLKYNIDVVCEYIVKKIPIPERNFTSPPNMIVIRSFDVNKPG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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