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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000106`

染色体: Chr06 坐标: 753561-757988 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000106`
名称	SmilChr06G000106
描述	putative clathrin assembly protein At5g35200
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	753561 - 757988 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987653`
GeneID	`130987653`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987653`
原始查询	`SmilChr06G000106`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative clathrin assembly protein At5g35200
产物	putative clathrin assembly protein At5g35200
Arabidopsis	`AT5G35200` (AT5G35200) ENTH/ANTH/VHS superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833474] identity=48.5; qcov=0.735; evalue=3.18e-130; confidence=high
Rice	`Os06g0175500` - identity=44.3; qcov=0.828; evalue=7.65e-124; confidence=medium
GO	GO:0000149 (SNARE binding); GO:0005545 (1-phosphatidylinositol binding); GO:0005546 (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate binding); GO:0005905 (clathrin-coated pit); GO:0006900 (vesicle budding from membrane); GO:0030136 (clathrin-coated vesicle); GO:0032050 (clathrin heavy chain binding); GO:0048268 (clathrin coat assembly); GO:0072583 (clathrin-dependent endocytosis)
KEGG	-
Pfam	PF07651 (ANTH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987653

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057767235.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057767235.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057767235.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767235.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767235.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:753892`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B6
`Chr6:753954`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B119,B83
`Chr6:754041`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:754074`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B19,B42,B43
`Chr6:754092`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B130,B36,B7
`Chr6:754197`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr6:754262`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B130,B36,B7
`Chr6:754289`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr6:754558`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B6,C67
`Chr6:754564`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B45
`Chr6:754564`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B45
`Chr6:754857`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,B108

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767235.1

603 aa

302

603

ANTH

PF07651 ANTH 32-298 aa

XP_057767236.1

603 aa

302

603

ANTH

PF07651 ANTH 32-298 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767235.1`	Pfam	`PF07651`	ANTH	Repeat	32	298	1.2e-66	225.3	ANTH domain
`XP_057767236.1`	Pfam	`PF07651`	ANTH	Repeat	32	298	1.2e-66	225.3	ANTH domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911252.1
GTTTAGGTGCGTAGAGCTAGAGTTTATTAATTAAATGCAAATTCCTTCCATCCATGGCAGAAACGATGAGCTTCTTCATTCTCCCGCGGGAATGACATTGCGTTGCAGATCTTTTCTTTGATCTCATCCATCGTTTTCTCTCTCTACTCTTCAGGCTGTTTGGATCTCTCTGATTTCGGTTCTTCACAAAAATGGCTGCCGGGACCAATAGCCAGCAAAGTTTTAGGAACGCGATTAAATCTATCATTAAGGAATCTACA...

XM_057911253.1
CAAATTCCTTCCATCCATGGCAGAAACGATGAGCTTCTTCATTCTCCCGCGGGAATGACATTGCGTTGCAGATCTTTTCTTTGATCTCATCCATCGTTTTCTCTCTCTACTCTTCAGGTATGTAATTGCTTCATTGCCGCCATCCACCTGCCGATCTGTTCACGCTGTTTGGATCTCTCTGATTTCGGTTCTTCACAAAAATGGCTGCCGGGACCAATAGCCAGCAAAGTTTTAGGAACGCGATTAAATCTATCATTAAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130987653
ATGGCTGCCGGGACCAATAGCCAGCAAAGTTTTAGGAACGCGATTAAATCTATCATTAAGGAATCTACATCAGTGAATAGTCAATATAAGCACATAAAAGTCACCATTATTAAAGCCACAAACCACCTCGAATCGTTGCCCAAAGAGAAGCATGTACGAACTCTACTTGCCGCCGTCTCTGGTTCAAGACCTCGAGCTGATGTTGGTTATTGTATTCATGCACTTAAAATGCGTCTTGCACAGGCAGATTCTTGGGTGGT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057767235.1
MAAGTNSQQSFRNAIKSIIKESTSVNSQYKHIKVTIIKATNHLESLPKEKHVRTLLAAVSGSRPRADVGYCIHALKMRLAQADSWVVALKILIVVHRALREVDRSFLEELSFHSKHRRHMFNLLHFKDKTSPSTMDYSAWIRTYALYIEECLQCFRVLKYDFYSDPTRTKNLDIPALLEQLPALQQLLLRLLCCQPIGAATYNYMVQFTLSMVAAESVKLYVAITDGVLILVDKFFEMQRGDAVAAHAIYRRAVEQAQRL...

XP_057767236.1
MAAGTNSQQSFRNAIKSIIKESTSVNSQYKHIKVTIIKATNHLESLPKEKHVRTLLAAVSGSRPRADVGYCIHALKMRLAQADSWVVALKILIVVHRALREVDRSFLEELSFHSKHRRHMFNLLHFKDKTSPSTMDYSAWIRTYALYIEECLQCFRVLKYDFYSDPTRTKNLDIPALLEQLPALQQLLLRLLCCQPIGAATYNYMVQFTLSMVAAESVKLYVAITDGVLILVDKFFEMQRGDAVAAHAIYRRAVEQAQRL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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