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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000124`

染色体: Chr06 坐标: 877010-878723 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000124`
名称	SmilChr06G000124
描述	zinc finger protein CONSTANS-LIKE 5-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	877010 - 878723 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987669`
GeneID	`130987669`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987669`
原始查询	`SmilChr06G000124`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger protein CONSTANS-LIKE 5-like
产物	zinc finger protein CONSTANS-LIKE 5-like
Arabidopsis	`AT5G57660` (COL5) CONSTANS-like 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835872] identity=50; qcov=0.984; evalue=2.55e-94; confidence=high
Rice	`Os04g0497700` (OsBBX12) - identity=43.2; qcov=0.87; evalue=9.04e-56; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0009909 (regulation of flower development); GO:2000028 (regulation of photoperiodism, flowering)
KEGG	-
Pfam	PF00643 (zf-B_box); PF06203 (CCT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987669

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057767259.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767259.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767259.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057767259.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057767259.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:877283`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr6:877417`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,C13
`Chr6:877444`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,C13
`Chr6:877517`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B14,C75,D11
`Chr6:877610`	`AC`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B69
`Chr6:877621`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B9,C43
`Chr6:877806`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:877819`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr6:877899`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B9,C43
`Chr6:877943`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr6:878232`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B38

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767259.1

370 aa

185

370

zf-B_box

CCT

PF00643 zf-B_box 65-107 aa PF06203 CCT 298-340 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767259.1`	Pfam	`PF00643`	zf-B_box	Domain	65	107	1.3e-10	42.0	B-box zinc finger
`XP_057767259.1`	Pfam	`PF06203`	CCT	Motif	298	340	3e-18	66.3	CCT motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911276.1
ATACTCTAGCACGAAATATCATCATCTCGGATGTCATGAAGCCTTTTCCGCGGCTCATATCGCTCCACGTGTCCCGCCAAATCCCCCATTTCTCTCTCCTCTCCACAGCTTAGATAGAGATTCAGACTCTCCCCCATTTTCGAACCCACACCACACTACTCACGCCTAGTCATCAACTACATCTTAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGAGAGAGGGAGAGAGAACTAACCGAATGGGGGTGACGCTAGATGCTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987669
ATGGGGGTGACGCTAGATGCTGGTGAAGGCGCCAGGGAGAGGTGTTTTCCGGCGGGGTGGAATGCGGCGGCGAAGCCGTGCGACTACTGCAAGTCCGCGGCGGCGCTGCTCTTCTGCCGCGCGCACTCCGCTTTCATGTGCATGGTGTGCGACGCCAAGCTTCACAATGCCGGCGGCGGCGCGAGGCACGGGAAGGTGTGGATATGCGAGGTCTGTGAGCAGGCACCGGCCGCCGTCACCTGCAAGGCGGACGCCGCCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767259.1
MGVTLDAGEGARERCFPAGWNAAAKPCDYCKSAAALLFCRAHSAFMCMVCDAKLHNAGGGARHGKVWICEVCEQAPAAVTCKADAAALCVTCDRDIHSANPLAQRHDRAAVVPFYDTAETEVMKSTAAIFDDAPDADSICDRKLGDYVGDSWISTNPIVPAKLPAAAADAPEMKSLEFLFSDSDQFLDFDGYRICSQPYGDGLVPVQATATPPLSAQLTHQHSPDNRFEIDFTRSNITSYTNSYTAASLSHTVSSSSMDV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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