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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000156`

染色体: Chr06 坐标: 1081208-1087748 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000156`
名称	SmilChr06G000156
描述	uncharacterized SmilChr06G000156
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	1081208 - 1087748 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987699`
GeneID	`130987699`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987699`
原始查询	`SmilChr06G000156`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0659150; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os04g0659150; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os04g0659150` - identity=35; qcov=0.197; evalue=1.16e-12; confidence=weak
GO	GO:0005730 (nucleolus); GO:0032453 (histone H3K4 demethylase activity); GO:0034720 (GO:0034720); GO:0051864 (histone H3K36 demethylase activity); GO:0070544 (GO:0070544)
KEGG	-
Pfam	PF08007 (JmjC_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987699

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057767301.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767301.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767301.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057767301.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057767301.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:1084581`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,B112,B138,B64,C61
`Chr6:1084604`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B25
`Chr6:1084604`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B25
`Chr6:1084607`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B25
`Chr6:1084607`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B25
`Chr6:1084623`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B125
`Chr6:1084649`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B40,C27,C35
`Chr6:1084659`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B105
`Chr6:1084704`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,B135
`Chr6:1084816`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B19,B88,C18,C6,C9
`Chr6:1084849`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,B113,B16,C37,D6
`Chr6:1084910`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C57,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767301.1

780 aa

390

780

JmjC_2

PF08007 JmjC_2 433-546 aa

XP_057767302.1

726 aa

363

726

JmjC_2

PF08007 JmjC_2 433-546 aa

XP_057767303.1

726 aa

363

726

JmjC_2

PF08007 JmjC_2 433-546 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767301.1`	Pfam	`PF08007`	JmjC_2	Domain	433	546	7.5e-21	74.7	JmjC domain
`XP_057767302.1`	Pfam	`PF08007`	JmjC_2	Domain	433	546	7e-21	74.8	JmjC domain
`XP_057767303.1`	Pfam	`PF08007`	JmjC_2	Domain	433	546	7e-21	74.8	JmjC domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911320.1
CCGAAATTGAAGTCGACAATACTGGAACGAAAATGGAAGAACAGAAGGCGAAGAGAAAAAGAGGAATCGCGATGAAGAGCAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAACTTGTGTAATGATGAAACCGTTTTTCCATTGCTGTTAGCATCCTTTTCTTCGAAGCCTCACGTGGAAAAAGCCCTAATTAAGAAATATTTGAACAAGATATTTCTCTCGCTTCCTCACTTGCACTTGCCGCCAATCCTCGCGTTGCTTCCCTCGCTC...

XM_057911319.1
CCGAAATTGAAGTCGACAATACTGGAACGAAAATGGAAGAACAGAAGGCGAAGAGAAAAAGAGGAATCGCGATGAAGAGCAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAACTTGTGTAATGATGAAACCGTTTTTCCATTGCTGTTAGCATCCTTTTCTTCGAAGCCTCACGTGGAAAAAGCCCTAATTAAGAAATATTTGAACAAGATATTTCTCTCGCTTCCTCACTTGCACTTGCCGCCAATCCTCGCGTTGCTTCCCTCGCTC...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130987699
ATGGAAGAACAGAAGGCGAAGAGAAAAAGAGGAATCGCGATGAAGAGCAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGAACTTGTGTAATGATGAAACCGTTTTTCCATTGCTGTTAGCATCCTTTTCTTCGAAGCCTCACGTGGAAAAAGCCCTAATTAAGAAATATTTGAACAAGATATTTCTCTCGCTTCCTCACTTGCACTTGCCGCCAATCCTCGCGTTGCTTCCCTCGCTCTTGAAATCCGACTGTGCTGAAATTGTGTGCAA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057767301.1
MEEQKAKRKRGIAMKSKKKKKKRNLCNDETVFPLLLASFSSKPHVEKALIKKYLNKIFLSLPHLHLPPILALLPSLLKSDCAEIVCKSADIVGAASLAFLEMSELIAAEDEIVRRMIALVGNSEREIAIAACNAVLDLSAGSVGRQRLLEFGAIEIFILRLMQGIKPPAATVGIAADTTLLKEDEHSILLLQGATTLINSASLEQLQLIPTDTCETLLVHLRGLLRQVHKQRLFSTSSTCDQGNELYASNIRVYNLVESV...

XP_057767302.1
MEEQKAKRKRGIAMKSKKKKKKRNLCNDETVFPLLLASFSSKPHVEKALIKKYLNKIFLSLPHLHLPPILALLPSLLKSDCAEIVCKSADIVGAASLAFLEMSELIAAEDEIVRRMIALVGNSEREIAIAACNAVLDLSAGSVGRQRLLEFGAIEIFILRLMQGIKPPAATVGIAADTTLLKEDEHSILLLQGATTLINSASLEQLQLIPTDTCETLLVHLRGLLRQVHKQRLFSTSSTCDQGNELYASNIRVYNLVESV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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