当前解析结果
SmilChr06G000160| 统一新 Gene ID | SmilChr06G000160 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G000160 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G000160 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 1119049 - 1126183 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130987705 |
|---|---|
| GeneID | 130987705 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130987705 |
| 原始查询 | SmilChr06G000160 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | CHR729; symbol=CHR729; hit=Os07g0497100; species=rice; confidence=weak |
| 产物 | CHR729; symbol=CHR729; hit=Os07g0497100; species=rice; confidence=weak |
| Arabidopsis | AT5G44800 (CHR4)chromatin remodeling 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834510] identity=42.7; qcov=0.114; evalue=1.29e-12; confidence=weak |
| Rice | Os07g0497100 (CHR729)- identity=40.9; qcov=0.129; evalue=1.64e-17; confidence=weak |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130987705 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057767314.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 0.80000 | XP_057767318.1 |
| 3 | Nuclear body | 核内小体 | 0.20000 | XP_057767318.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057767314.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057767314.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:1120796 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A23,B109,B123,C47 |
Chr6:1121391 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A23 |
Chr6:1122228 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B1,B44,C41 |
Chr6:1122468 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B59,C22 |
Chr6:1122541 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B111,B129,B31 |
Chr6:1122597 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A23 |
Chr6:1122738 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A7,B16,C17,C53 |
Chr6:1123622 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B59,C22 |
Chr6:1123730 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A7,B49,C87 |
Chr6:1123766 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C41 |
Chr6:1123893 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B102,B89,C14,C29,C85 |
Chr6:1123944 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C43,C72 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
6 records
下载 cDNA FASTA6 records
下载 CDS FASTA6 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。