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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000171`

染色体: Chr06 坐标: 1180107-1188721 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000171`
名称	SmilChr06G000171
描述	transcription factor IIIB 70 kDa subunit-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	1180107 - 1188721 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987715`
GeneID	`130987715`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987715`
原始查询	`SmilChr06G000171`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor IIIB 70 kDa subunit-like
产物	transcription factor IIIB 70 kDa subunit-like
Arabidopsis	`AT3G09360` (AT3G09360) Cyclin/Brf1-like TBP-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820092] identity=43.6; qcov=0.984; evalue=1.28e-125; confidence=medium
Rice	`Os05g0305100` - identity=43.4; qcov=1.03; evalue=2.04e-143; confidence=medium
GO	GO:0000126 (transcription factor TFIIIB complex); GO:0000995 (RNA polymerase III general transcription initiation factor activity); GO:0001006 (RNA polymerase III type 3 promoter sequence-specific DNA binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006352 (DNA-templated transcription initiation); GO:0006383 (transcription by RNA polymerase III); GO:0017025 (TBP-class protein binding); GO:0070897 (transcription preinitiation complex assembly); GO:0097550 (transcription preinitiation complex)
KEGG	-
Pfam	PF00382 (TFIIB); PF07741 (BRF1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987715

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057767333.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057767334.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767333.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767333.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057767333.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:1180360`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr6:1181300`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B113,B82
`Chr6:1182639`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:1182652`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B24,B78
`Chr6:1182652`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B24,B78
`Chr6:1183345`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A1,C8
`Chr6:1183570`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B6,C67
`Chr6:1183597`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,B38,B39,D1
`Chr6:1186508`	`GGT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	62	A10,A14,A15,A3,A8,B10,B105,B111,B117,B118,B119,B129,B130,B132,B138,B15,B23,B24,B28,B30,B31,B32,B34,B53,B54,B60,B64,B69,B71,B72,B73,B82,B84,B93,B94,C14,C15,C17,C24,C26,C30,C32,C34,C37,C4,C41,C49,C50,C53,C56,C59,C64,C65,C66,C68,C71,C74,C79,C82,C84,D11,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767333.1

599 aa

300

599

TFIIB

BRF1

PF00382 TFIIB 65-156 aa PF00382 TFIIB 167-257 aa PF07741 BRF1 427-548 aa

XP_057767334.1

580 aa

290

580

TFIIB

BRF1

PF00382 TFIIB 65-124 aa PF00382 TFIIB 148-238 aa PF07741 BRF1 408-529 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767333.1`	Pfam	`PF00382`	TFIIB	Domain	65	156	4.1e-35	120.4	Transcription factor TFIIB repeat
`XP_057767333.1`	Pfam	`PF00382`	TFIIB	Domain	167	257	4.1e-35	120.4	Transcription factor TFIIB repeat
`XP_057767333.1`	Pfam	`PF07741`	BRF1	Domain	427	548	2.1e-21	76.8	Brf1-like TBP-binding domain
`XP_057767334.1`	Pfam	`PF00382`	TFIIB	Domain	65	124	1.1e-28	99.8	Transcription factor TFIIB repeat
`XP_057767334.1`	Pfam	`PF00382`	TFIIB	Domain	148	238	1.1e-28	99.8	Transcription factor TFIIB repeat
`XP_057767334.1`	Pfam	`PF07741`	BRF1	Domain	408	529	2.8e-20	73.2	Brf1-like TBP-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911351.1
CGCCGCTACCGTTTCCCTCGCCCACTTAAAACAGTTGAACCTCAACTGGATCGTGCCAAAACCCCACCATCTCCAAATTCTGCGTTGATAAAATTAAATTTCAAACCGTCGATCCGCCGCCGCGATTGTTTCTTTCCCGCGCCTTGGATCGGATAAATCGCGTTTTTACCACTGCCGAGATTTTACCCCGCCCAAAGAGACCAACTTCACTCCCGTATCAATTGCGCCGCTGCGGAAGCGAAGTCATTAGCTTCAGCTGA...

XM_057911350.1
CGCCGCTACCGTTTCCCTCGCCCACTTAAAACAGTTGAACCTCAACTGGATCGTGCCAAAACCCCACCATCTCCAAATTCTGCGTTGATAAAATTAAATTTCAAACCGTCGATCCGCCGCCGCGATTGTTTCTTTCCCGCGCCTTGGATCGGATAAATCGCGTTTTTACCACTGCCGAGATTTTACCCCGCCCAAAGAGACCAACTTCACTCCCGTATCAATTGCGCCGCTGCGGAAGCGAAGTCATTAGCTTCAGCTGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130987715
ATGTGGTGCGATAACTGTGCCAAAAATGTGCGGACTGATAACACTGAAGGAAAAGCATGCTGTTCGCTTTGCGGGAAGGTTCTTGCTGAGGATAACTTTACGGAGGAGGTTCAATTTACAAAATCATCTAATGGACAGGCACGCCTGCAAGGTAGCTTTGTGGAGTCCGTCCGAGGTCATTCTGAAAGTCATGAGCGAACATTGACTGAAGCTTATTATGGAATAAAAAATATAATGTATGCCCTCGAAATTGACGGTGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057767333.1
MWCDNCAKNVRTDNTEGKACCSLCGKVLAEDNFTEEVQFTKSSNGQARLQGSFVESVRGHSESHERTLTEAYYGIKNIMYALEIDGGDYIANVASKFYEAALGKNFTRGRRKEQVQAACLYITCRVKKKPYLLIDFSEHLRVNVYVLGAVFLQLCKALNLGESDLLQNLVDPSLFIHRFADRLFKTRDRNVSKTALQIVASMKRDWMQSGRKPSGLCGAALYISALAHGLNCSKSEIIKTVHICEATLTKRLIEFENTES...

XP_057767334.1
MWCDNCAKNVRTDNTEGKACCSLCGKVLAEDNFTEEVQFTKSSNGQARLQGSFVESVRGHSESHERTLTEAYYGIKNIMYALEIDGGDYIANVASKFYEAALGKNFTRGRRKEQVQAACLYITCSYVLGAVFLQLCKALNLGESDLLQNLVDPSLFIHRFADRLFKTRDRNVSKTALQIVASMKRDWMQSGRKPSGLCGAALYISALAHGLNCSKSEIIKTVHICEATLTKRLIEFENTESGGLTIEEFEKKSEELAAME...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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