当前解析结果
SmilChr06G000180| 统一新 Gene ID | SmilChr06G000180 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G000180 |
| 描述 | UDP-glycosyltransferase 74G1-like |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 1257697 - 1259706 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130987727 |
|---|---|
| GeneID | 130987727 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130987727 |
| 原始查询 | SmilChr06G000180 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | UDP-glycosyltransferase 74G1-like |
| 产物 | UDP-glycosyltransferase 74G1-like |
| Arabidopsis | AT1G05675 (AT1G05675)UDP-Glycosyltransferase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:10723139] identity=46.3; qcov=0.985; evalue=3.87e-141; confidence=high |
| Rice | Os09g0518200 (OsSGT)- identity=46.4; qcov=1; evalue=7.32e-138; confidence=high |
| GO | GO:0008194 (UDP-glycosyltransferase activity) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00201 (UDPGT) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130987727 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytosol | 细胞质基质 | 1.00000 | XP_057767356.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057767356.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057767356.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057767356.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057767356.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:1257851 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C37,D6 |
Chr6:1257866 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr6:1257877 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B40 |
Chr6:1257953 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B40 |
Chr6:1257973 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B26,C86 |
Chr6:1257997 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A3,B32,C37 |
Chr6:1258018 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B25,C80,C86 |
Chr6:1258031 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B131,B7,C42,C85 |
Chr6:1258064 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A14,B76,C4,C64,C66 |
Chr6:1258081 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C86 |
Chr6:1258093 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B13 |
Chr6:1258096 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B131,B7,C42,C85 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057767356.1PF00201
UDPGT 255-422 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057767356.1 |
Pfam | PF00201 |
UDPGT | Family | 255 | 422 | 3.6e-26 | 92.7 | UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。