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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000181`

染色体: Chr06 坐标: 1261411-1263547 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000181`
名称	SmilChr06G000181
描述	40S ribosomal protein S2-4-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	1261411 - 1263547 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987728`
GeneID	`130987728`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987728`
原始查询	`SmilChr06G000181`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	40S ribosomal protein S2-4-like
产物	40S ribosomal protein S2-4-like
Arabidopsis	`AT3G57490` (AT3G57490) Ribosomal protein S5 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824916] identity=89.1; qcov=0.852; evalue=5.11e-150; confidence=high
Rice	`Os03g0807800` (SUP44) - identity=85.3; qcov=0.856; evalue=2.16e-145; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0022627 (cytosolic small ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00333 (Ribosomal_S5); PF03719 (Ribosomal_S5_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987728

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057767357.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057767357.1`
3	Nucleolus	核仁	0.40000	`XP_057767357.1`
4	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057767357.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767357.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:1261701`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,B29,B51
`Chr6:1261719`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr6:1261884`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,C26,C31
`Chr6:1262051`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr6:1262139`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B33,B53,C51,C76
`Chr6:1263292`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,A18,B99,C60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767357.1

270 aa

135

270

Ribosomal_S5

Ribosomal_S5_C

PF00333 Ribosomal_S5 85-149 aa PF03719 Ribosomal_S5_C 169-240 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767357.1`	Pfam	`PF00333`	Ribosomal_S5	Domain	85	149	8.1e-31	106.6	Ribosomal protein S5, N-terminal domain
`XP_057767357.1`	Pfam	`PF03719`	Ribosomal_S5_C	Domain	169	240	5e-24	84.3	Ribosomal protein S5, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911374.1
GTTTATCAGCCCAATTATCTGTATATAAACCCTTCCTTTATCCTAGGGTTTCACCTTCTGCCACATACACACACAGGCGTTCAGCTGTCTCTCTCATCACCCCTTCCTCCCTATCTCCCAGCTACAATCATGGCGGATAGAGGCGCAGGCGACCGCGGCGGCTTCGGCCGTGGATTCGGGGGCCGGGGTCGCGGCGGAGACAGAGGCGGCCGAGGGCGTGGCCGCCGTCCCCGCCGCGAGGCGGAGGAGGAGAAATGGGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987728
ATGGCGGATAGAGGCGCAGGCGACCGCGGCGGCTTCGGCCGTGGATTCGGGGGCCGGGGTCGCGGCGGAGACAGAGGCGGCCGAGGGCGTGGCCGCCGTCCCCGCCGCGAGGCGGAGGAGGAGAAATGGGTCCCCGTCACCAAGCTCGGCCGGCTGGTGAGGGACGGCAAGATCAAATCCCTCGAGCAAATCTACCTCCACTCCCTCCCAATCAAGGAGTACCAAATCATCGATGCCCTAGTTGGCCCGTCGCTCAAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767357.1
MADRGAGDRGGFGRGFGGRGRGGDRGGRGRGRRPRREAEEEKWVPVTKLGRLVRDGKIKSLEQIYLHSLPIKEYQIIDALVGPSLKDEVMKIMPVQKQTRAGQRTRFKAFVVVGDGNGHVGLGVKCSKEVATAIRGAIILAKLSVIPVRRGYWGNKIGKPHTVPCKVTGKCGSVLVRMVPAPRGSGIVAARVPKKVLQFAGIDDVFTCSRGSTKTLGNFVKATFDCLLKTYGFLTPDFWRETRFSKSPFQEYTDLLAKPT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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