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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000186`

染色体: Chr06 坐标: 1283006-1290762 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000186`
名称	SmilChr06G000186
描述	uncharacterized SmilChr06G000186
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	1283006 - 1290762 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987733`
GeneID	`130987733`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987733`
原始查询	`SmilChr06G000186`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0636700; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os04g0636700; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G26990` (AT3G26990) ENTH/VHS family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822316] identity=44.8; qcov=0.72; evalue=4.66e-88; confidence=medium
Rice	`Os04g0636700` - identity=42.1; qcov=0.793; evalue=1.76e-101; confidence=medium
GO	GO:0000993 (RNA polymerase II complex binding); GO:0016591 (RNA polymerase II, holoenzyme); GO:0031124 (mRNA 3'-end processing)
KEGG	-
Pfam	PF04818 (CID)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987733

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057767365.1`
2	Nuclear pore complex	核孔复合体	0.20000	`XP_057767365.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767365.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767365.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057767365.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:1286443`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B89
`Chr6:1286493`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr6:1286533`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B34,C66
`Chr6:1286650`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr6:1286677`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B29,B69,C63,C76,C87
`Chr6:1286684`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B9,B99,C12,C43
`Chr6:1288047`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B3,C2,C63
`Chr6:1288070`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:1288495`	`CAG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	14	A25,A7,B137,B37,B40,B53,B77,B93,C48,C62,C72,C85,C87,D8
`Chr6:1288524`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B26,B58,B78
`Chr6:1288532`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B104,B58
`Chr6:1288532`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B104,B58

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767365.1

536 aa

268

536

CID

PF04818 CID 10-121 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767365.1`	Pfam	`PF04818`	CID	Repeat	10	121	2.8e-37	128.3	CID domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911382.1
AAATATATCAATTGTTGCACAGTTTTATAACTGCTATTTTCAGTTAAGCCCCACTTATTTTCACTCTCTCTCTCCGTCGCCCTATTTTCCCTCAGACAACCCTCGGGCTCTCATTGTTGAGGGTTTTCTCTCTCTTCACCGTCTCAAAGTTTTTTTGCTGGATTGAGCCCGCTGGCTGTAAGAGTTTCAAGCGTACGGGGTTCTCTTGGAATTACTAGGCAACTTGAACTACAATTTTATGGGAATAATCCAGTGCACTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987733
ATGGGTGATGAAAATTTTAATGAGACGATCCTGACTGAGAAACTGTCTAAACTAAACAGTTCTCAGCAAAGCATTGAGTCTTTGTCTCGGTGGTGCATTTCTCATCGTAAAAAAGCTAAGCAAGTTGTTGAAACGTGGGAGAAATTATTCAAAGCAGCACCAAATGAACAACGCGTTTCCTTTTTATACTTGTCCAATGACATCCTGCAAAATAGCAGGCGCAAAGGCAGTGAATTTGTCAATGAATTCTGGAAGGTTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767365.1
MGDENFNETILTEKLSKLNSSQQSIESLSRWCISHRKKAKQVVETWEKLFKAAPNEQRVSFLYLSNDILQNSRRKGSEFVNEFWKVLPTALKIVYDSGNESCRKVAFRLVDIWEERKVFGSRGQNLKNEMLGKNPSPVNNGKTSIPNPIKVVKRDATSVRIKLAVGGLPEKILTALQLVHDEAVNEETTLGKFQKAISSVQEIEKDVLYASSQGNLNGSDVVDNLERQESTIKQCIDELEKSEAVRVSLVSQLREALQDQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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