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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID,以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因,再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr06G000193

染色体: Chr06 坐标: 1332861-1333806 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr06G000193
名称SmilChr06G000193
描述probable ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD14
染色体 / SeqIDChr06 / NC_080392.1
坐标与链方向1332861 - 1333806 / +

ID 对照

NCBI Gene IDLOC130987747
GeneID130987747
locus_tag-
NCBI NameLOC130987747
原始查询SmilChr06G000193

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述probable ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD14
产物probable ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD14
ArabidopsisAT1G08680 (ZIGA4)
ARF GAP-like zinc finger-containing protein ZIGA4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837390]
identity=47.4; qcov=1; evalue=2.27e-12; confidence=low
Rice-
-
GO-
KEGG-
Pfam-
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:130987747

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Cytoplasm 细胞质 1.00000 XP_057767381.1
2 Nucleus 细胞核 0.20000 XP_057767381.1
3 Cytoplasmic granule 细胞质颗粒 0.20000 XP_057767381.1
4 Cytosol 细胞质基质 0.20000 XP_057767381.1
5 Endosome 内体 0.20000 XP_057767381.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变,或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中,此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA(仅基因区域)

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA
XM_057911398.1
ATATTATACCATTGTGTGTTTAGGCTCAATTCTGGGACATGAGCTCGTTGCAAGCAGCTCTTCCGAGTAATCAGGCACCGGCTACCTATGTTAATGATGTGAATGAATCCTGGTTTCCCCAGAATTCTGTTGCATCATACGTCCCCGGTGCCGCTGCATTTGATCCTCTAAATGCAGGCTCTTTCGGGTATATAGTCGGGCAAGTGCCAACCACCCAAATACAGAGCAGCCCTGCTCAAGGCCCCGTTGCATCCATCGGG...
XM_057911399.1
TACCATTGTGTGTTTAGGCTCAATTCTGGGACATGAGCTCGTTGCAAGCAGCTCTTCCGAGTAATCAGGCACCGGCTACCTATGTTAATGATGTGAATGAATCCTGGTTTCCCCAGAATTCTGTTGCATCATACGTCCCCGGTGCCGCTGCATTTGATCCTCTAAATGGCTCTTTCGGGTATATAGTCGGGCAAGTGCCAACCACCCAAATACAGAGCAGCCCTGCTCAAGGCCCCGTTGCATCCATCGGGGGCAATCCT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA
LOC130987747
ATGAGCTCGTTGCAAGCAGCTCTTCCGAGTAATCAGGCACCGGCTACCTATGTTAATGATGTGAATGAATCCTGGTTTCCCCAGAATTCTGTTGCATCATACGTCCCCGGTGCCGCTGCATTTGATCCTCTAAATGCAGGCTCTTTCGGGTATATAGTCGGGCAAGTGCCAACCACCCAAATACAGAGCAGCCCTGCTCAAGGCCCCGTTGCATCCATCGGGGGCAATCCTTTTGCATAG
LOC130987747
ATGAGCTCGTTGCAAGCAGCTCTTCCGAGTAATCAGGCACCGGCTACCTATGTTAATGATGTGAATGAATCCTGGTTTCCCCAGAATTCTGTTGCATCATACGTCCCCGGTGCCGCTGCATTTGATCCTCTAAATGGCTCTTTCGGGTATATAGTCGGGCAAGTGCCAACCACCCAAATACAGAGCAGCCCTGCTCAAGGCCCCGTTGCATCCATCGGGGGCAATCCTTTTGCATAG

Protein

2 records

下载 Protein FASTA
XP_057767381.1
MSSLQAALPSNQAPATYVNDVNESWFPQNSVASYVPGAAAFDPLNAGSFGYIVGQVPTTQIQSSPAQGPVASIGGNPFA
XP_057767382.1
MSSLQAALPSNQAPATYVNDVNESWFPQNSVASYVPGAAAFDPLNGSFGYIVGQVPTTQIQSSPAQGPVASIGGNPFA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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