当前解析结果
SmilChr06G000201| 统一新 Gene ID | SmilChr06G000201 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G000201 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G000201 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 1381959 - 1385695 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130987749 |
|---|---|
| GeneID | 130987749 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130987749 |
| 原始查询 | SmilChr06G000201 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os02g0502500; species=rice; confidence=high |
| 产物 | hit=Os02g0502500; species=rice; confidence=high |
| Arabidopsis | AT2G40980 (AT2G40980)Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818698] identity=73.4; qcov=0.7; evalue=0; confidence=high |
| Rice | Os02g0502500- identity=62.2; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130987749 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057767383.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057767383.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.80000 | XP_057767383.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057767383.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057767383.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:1382186 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B62 |
Chr6:1383133 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B75 |
Chr6:1383209 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B90,B92 |
Chr6:1383278 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A18,A4,A6,B106,B81 |
Chr6:1383365 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B104,B19,B69,C25,D1 |
Chr6:1383671 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B26 |
Chr6:1383716 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B9,C43 |
Chr6:1383797 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B84 |
Chr6:1383884 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B107,B48,D5 |
Chr6:1384170 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B2,B93,C51 |
Chr6:1384196 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A16,A20,B41 |
Chr6:1384199 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B1 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。