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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000214`

染色体: Chr06 坐标: 1431155-1434387 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000214`
名称	SmilChr06G000214
描述	probable disease resistance protein At1g58602
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	1431155 - 1434387 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987762`
GeneID	`130987762`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987762`
原始查询	`SmilChr06G000214`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable disease resistance protein At1g58602
产物	probable disease resistance protein At1g58602
Arabidopsis	`AT1G58390` (AT1G58390) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842208] identity=32.5; qcov=1.03; evalue=2.7e-137; confidence=low
Rice	`Os01g0547000` - identity=26.9; qcov=1.06; evalue=8.34e-70; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF13191 (AAA_16); PF18052 (Rx_N); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987762

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057767405.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767405.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767405.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767405.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057767405.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:1431471`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B70
`Chr6:1431477`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B70
`Chr6:1431519`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B75,B95,C26,C77
`Chr6:1431975`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,B136,B81,C15
`Chr6:1432007`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr6:1432015`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,B139,B22
`Chr6:1432100`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C57
`Chr6:1432100`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C57
`Chr6:1432104`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C57
`Chr6:1432104`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C57
`Chr6:1432133`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr6:1432134`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767405.1

910 aa

455

910

Rx_N

AAA_16

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

PF18052 Rx_N 5-88 aa PF13191 AAA_16 160-269 aa PF00931 NB-ARC 164-329 aa PF23559 WHD_DRP 416-493 aa PF23598 LRR_14 572-885 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767405.1`	Pfam	`PF18052`	Rx_N	Domain	5	88	8.2e-19	68.2	Rx N-terminal domain
`XP_057767405.1`	Pfam	`PF13191`	AAA_16	Domain	160	269	1.1e-08	36.5	AAA ATPase domain
`XP_057767405.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	164	329	1e-34	120.3	NB-ARC domain
`XP_057767405.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	416	493	3.9e-10	40.4	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057767405.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	572	885	5.4e-26	91.9	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911422.1
GGGAAATGGTCTAAAGAGTAGCTACCTTGACAAGTGGAATTAATAATCAAACCTCTCCCTGTTTTCTCATAGAACTCTCCAACTCCTAATTTCTCTGTTGCAGAATCCAAATTCTTCGCAATCTCGATTGAAGAATTTGTATTCACGACAACGAGTTCCTTATCCTTAATCCTCTACACACACTCTCACCAATAGTTGAATCAATTTGACCAAAGAAATTCAAGTTTGGAATTGTTGCGATGGCAGAAGCAGTGGTGTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987762
ATGGCAGAAGCAGTGGTGTCGACTGCTCTGGAAACCCTGCGCGATTTGTTGTTGGAAGAAGCAAGGTTTTTATCTGGCGTGGGCGACGAAGTGAAGGAGCTCGAGTGGCAGCTGAAAGAGATGAAGTGTCTTCTCAAAGACGCCGACAAAAGGCGACATGAAAGCAAAACCATTCTCAATTGGATCTCAGAGATCAGAGATCTTGTATACAAAGCCGAAGCTGCCATTGAAAGACACGCAGCTTATCAAGTGTCTTCGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767405.1
MAEAVVSTALETLRDLLLEEARFLSGVGDEVKELEWQLKEMKCLLKDADKRRHESKTILNWISEIRDLVYKAEAAIERHAAYQVSSRRRRGLRRCSCSLGEYKSIHRLGSEISPIKSRLERINKEMMENGIKKSIINSRDGGANNMSRKTFPEFEIGDCFVGMEDELKQLGNLLRRDNEDRVVSVWGMGGSGKTTIAKKLYNETGFDRCAWVCITQQCQSFQSVWEDVLKQLEPQVREEVVPSLSESELNERLCKAQRGK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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