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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000217`

染色体: Chr06 坐标: 1452018-1457449 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000217`
名称	SmilChr06G000217
描述	uncharacterized SmilChr06G000217
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	1452018 - 1457449 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987765`
GeneID	`130987765`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987765`
原始查询	`SmilChr06G000217`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Vacuolar protein sorting-associated protein 26 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841276]; symbol=AT1G48550; hit=AT1G48550; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Vacuolar protein sorting-associated protein 26 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841276]; symbol=AT1G48550; hit=AT1G48550; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G48550` (AT1G48550) Vacuolar protein sorting-associated protein 26 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841276] identity=67.3; qcov=0.994; evalue=5.14e-162; confidence=high
Rice	`-` -
GO	GO:0005768 (endosome); GO:0006886 (intracellular protein transport)
KEGG	-
Pfam	PF03643 (Vps26)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987765

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057767410.1`
2	Endocytic vesicle	Endocytic vesicle	0.40000	`XP_057767410.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057767410.1`
4	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057767410.1`
5	Vacuole membrane	液泡膜	0.40000	`XP_057767410.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:1452205`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B124,B140,B93,C51
`Chr6:1452416`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,B18,C81
`Chr6:1452443`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr6:1452988`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr6:1454317`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B69,C19
`Chr6:1454421`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,C13
`Chr6:1454422`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,B18,B48,C81
`Chr6:1454464`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B10
`Chr6:1454464`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B10
`Chr6:1454466`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B10
`Chr6:1454466`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B10
`Chr6:1454492`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767410.1

317 aa

158

317

Vps26

PF03643 Vps26 11-283 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767410.1`	Pfam	`PF03643`	Vps26	Family	11	283	1.7e-28	100.1	Vacuolar protein sorting-associated protein 26

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911427.1
AAATTCGTGTATTTTCCTGCTACTAACCGTTGTTTTTTTTATGTATATATATTTTAATTTTTGTAATTTTTTTTTATAAATTAATTTTTGTAATGTTAAGAAGAAGCAGCTTTGTCCGCAGGAGTGCCGGTGAGAAACTGAGTGAGGGTCGAATATTCCGGCAAGAGTCATGTCAGTTGAGATCAAACTCTCTCGATTCAACCGTATCTATCGCCACGATGAACTCCTTGAAGGAAAGGTAATCACGACGCTGAATTCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987765
ATGTCAGTTGAGATCAAACTCTCTCGATTCAACCGTATCTATCGCCACGATGAACTCCTTGAAGGAAAGGTAATCACGACGCTGAATTCTTCAATCTCCTACCAATCCATTCGCCTAACACTTAATGGCGCTGTCAATTTGCAGGTACGTGGCGGATCAGCTGGAGTTATTGAGTCCCTGTACGGTGTCATTAAGCCAATTCCAATTGTGAAGAAGGTTGTTGATATCCGATCATCTGGAAAGATAGGATCAGGTACGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767410.1
MSVEIKLSRFNRIYRHDELLEGKVITTLNSSISYQSIRLTLNGAVNLQVRGGSAGVIESLYGVIKPIPIVKKVVDIRSSGKIGSGTTEIPFSVILKDPKEKNLGRFYETFHGGNISIQYLVTVDIVRGYLHKPLSATIEYIVESAKDNLPQKPISPDMVIFYITQDTQRHTLLPELKSGGFRITGRICTQCSLSDPIDGELTVETSAVPIRSIDIHLLRVESILVGEKIATESSVIQETQIADGDVCRGMTLPIYIILPR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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