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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000228`

染色体: Chr06 坐标: 1531335-1535968 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000228`
名称	SmilChr06G000228
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	1531335 - 1535968 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987777`
GeneID	`130987777`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987777`
原始查询	`SmilChr06G000228`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
Arabidopsis	`AT5G48620` (AT5G48620) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834919] identity=28.6; qcov=1.02; evalue=2.26e-88; confidence=low
Rice	`Os06g0158300` (KMK0024M20.32) - identity=27.6; qcov=1.01; evalue=1.48e-73; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF18052 (Rx_N); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987777

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057767428.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767428.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767428.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767428.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057767428.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:1531728`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr6:1531785`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr6:1531790`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B20,B35,C42,C58
`Chr6:1531931`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C33,C80
`Chr6:1531932`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C33,C80
`Chr6:1531935`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C33,C80
`Chr6:1531941`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33
`Chr6:1532053`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr6:1532247`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr6:1532256`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr6:1532412`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B84,D11
`Chr6:1532625`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767428.1

883 aa

442

883

Rx_N

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

PF18052 Rx_N 5-87 aa PF00931 NB-ARC 163-326 aa PF23559 WHD_DRP 409-479 aa PF23598 LRR_14 535-811 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767428.1`	Pfam	`PF18052`	Rx_N	Domain	5	87	1.6e-16	60.9	Rx N-terminal domain
`XP_057767428.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	163	326	1.8e-44	152.1	NB-ARC domain
`XP_057767428.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	409	479	1.8e-20	73.5	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057767428.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	535	811	7.8e-20	71.6	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911445.1
AAAATAAAAAATAAAAAACAAATTCAAGTAGTTGGCAACTTTGTTCATTTCTTAACCAAGAACCAATAATGGTGTCCGCGTGGACCCACCAAGAATAAACTCGCAAATCCCAATATTACTCTCGACAAAGACTTTGCTTGTAGGGTCGTCGTCTCCGCCTTTCAGATCGAGAAATTTCGTCGAAGCATCATATATAGTTTCATCAACGCAGAGTGTCGACGCGCTATAAACACGCAGGAGATCGAGTAAATTCATGCGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987777
ATGGCGGAGGCGGCAGTGACGTTCCTGCTGGAGAACGTGCAGAAGCTGCTGGTGGAGCAGATGCATCTGATATCGGGGGCGGAGAAGGAGCTGAAGCAGCTGCAGTGCGAGCTGGAGCTGATGAACGCGTTCCTGATGGAGTACGCCGACAAGCGGGAGAAGGGGCAGGTGTTCATCCAGTTCGAGCGCCAGATCAGGGAGGCCGTGTACGAGGCCGAGGACACCCTCGACGCCTGCCTCACCCACAAGGCCAGGGCGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767428.1
MAEAAVTFLLENVQKLLVEQMHLISGAEKELKQLQCELELMNAFLMEYADKREKGQVFIQFERQIREAVYEAEDTLDACLTHKARAAGAGILSIKHLDLAKKVKELRLQLQPIFDRAIKGLNALPFAHPSAATLGTFDDNKFKKTQLLREDNVVGFADEEATLIKYLNEKTEQLDVISIVGMPGLGKTTLAWKIYRDPKIQFEFPTLIWVYVSQELNEREVFLTILKKFTRDDMSGKDDSELKQLVRYHLNKGRFLLFMD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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