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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000229`

染色体: Chr06 坐标: 1540443-1544384 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000229`
名称	SmilChr06G000229
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	1540443 - 1544384 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987774`
GeneID	`130987774`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987774`
原始查询	`SmilChr06G000229`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
Arabidopsis	`AT5G48620` (AT5G48620) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834919] identity=28.8; qcov=1.06; evalue=2.07e-88; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=30.2; qcov=0.774; evalue=4.97e-76; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF18052 (Rx_N); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987774

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057767423.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767423.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767423.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767423.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057767423.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:1541057`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B13,B69
`Chr6:1541164`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:1541203`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:1541358`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr6:1541518`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,C74
`Chr6:1541524`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr6:1541625`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr6:1541694`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B60,C56,C65,D11
`Chr6:1541785`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B13,B69
`Chr6:1542040`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr6:1542070`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr6:1542271`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,C13,C53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767423.1

886 aa

443

886

Rx_N

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

PF18052 Rx_N 5-92 aa PF00931 NB-ARC 163-328 aa PF23559 WHD_DRP 417-487 aa PF23598 LRR_14 543-823 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767423.1`	Pfam	`PF18052`	Rx_N	Domain	5	92	3e-18	66.4	Rx N-terminal domain
`XP_057767423.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	163	328	1.3e-45	155.8	NB-ARC domain
`XP_057767423.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	417	487	1.8e-21	76.7	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057767423.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	543	823	1.3e-19	70.9	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911440.1
AATTCTGAAGCACGAGCAGCCAGCCATTTTGTTTGTCCAGCTGAAAGTCGTCGCGGCAGTGCATTATTCACACACACACACAGTGGGAGAGGGAGAGAGAAGCGAAAATGGCGGAGCCGGCGGTGACATTCCTGCTGGAGAACGTGCAGAAGCTGCTGGTGGACCACATCAACCTGATCTCCGGCGCCGAGGCGGAGCTGCGGCACCTGCAGAATGAGCTGGAGCTGATGAAGGCCTTCCTGATCGAATCGGCGAACAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987774
ATGGCGGAGCCGGCGGTGACATTCCTGCTGGAGAACGTGCAGAAGCTGCTGGTGGACCACATCAACCTGATCTCCGGCGCCGAGGCGGAGCTGCGGCACCTGCAGAATGAGCTGGAGCTGATGAAGGCCTTCCTGATCGAATCGGCGAACAAGAGAGAGAAAGGGGAAGTTTTCCGGCAGCACGAGCGCCAAATCAGAGAGGTCGTCTACAAAGCCGAGGACACCCTCGACGCCTGCCTCACGCAGGCCGCCGCCGAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767423.1
MAEPAVTFLLENVQKLLVDHINLISGAEAELRHLQNELELMKAFLIESANKREKGEVFRQHERQIREVVYKAEDTLDACLTQAAAEKSKSFSFKTLNHKRYDLAKKVKALREQEVQPIFDRARLGFATLPMADPATAGPERPKTEDKKVPLLREDNVVGFDGEAETVIKKLTEESAELEVISIIGMPGLGKTTLAWKIYRDPQIQYEFPTLIWVYVSQDYNIKEVFLSILKKFTQQDMSCYDQSELARKVRSYLEKPKFL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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