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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000240`

染色体: Chr06 坐标: 1611367-1611861 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000240`
名称	SmilChr06G000240
描述	uncharacterized SmilChr06G000240
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	1611367 - 1611861 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990035`
GeneID	`130990035`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990035`
原始查询	`SmilChr06G000240`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=53.7; qcov=0.579; evalue=3.2e-31; confidence=medium
Rice	`Os01g0872900` - identity=44.2; qcov=0.994; evalue=2.92e-42; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990035

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770220.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057770220.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770220.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770220.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057770220.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:1611373`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	62	A10,A21,A23,A5,B105,B108,B109,B110,B111,B112,B113,B115,B119,B130,B132,B136,B14,B16,B19,B20,B31,B34,B42,B43,B46,B49,B55,B56,B6,B64,B71,B72,B73,B9,C12,C14,C15,C17,C18,C23,C25,C3,C32,C33,C34,C41,C44,C46,C49,C50,C52,C55,C57,C60,C64,C66,C68,C71,C76,C80,C81,D9
`Chr6:1611381`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,B134,B74,B86,C31
`Chr6:1611400`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C16,C64
`Chr6:1611405`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,C28
`Chr6:1611417`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	A3,B107,B120,B24,B54,C10,C59,C67,C81,C86
`Chr6:1611471`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B49,B9,C32,C68
`Chr6:1611480`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr6:1611481`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B49
`Chr6:1611481`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B49
`Chr6:1611499`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	A7,B134,B49,B62,B63,B90,B92,C21,C31,C39,C54
`Chr6:1611526`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B1,C53
`Chr6:1611526`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,C53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770220.1

164 aa

164

Plant_tran

PF04827 Plant_tran 2-98 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770220.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	2	98	2.4e-38	132.6	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914237.1
ATGTTTCAAGTCAACAACTCTTACTATCAGAAGGGATACTACTTGACCGACGACATCTACCCCAATTGGCCTATGTTTGTGAAGAGTCCTACACATCCTACAGACGAGAAGAGCAAGAGATTCAAGGTGATGCAGGAAGCTGCTCGCAAGGATATTGAACGAGCATTCGATGTTCTTCAATCTCGGTGGGCTATCATAAAAGGACCAGCGCGTCTTTGGAGCAAGGCGGAGTTGAGTGATATCATGTTCACGTGCATCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990035
ATGTTTCAAGTCAACAACTCTTACTATCAGAAGGGATACTACTTGACCGACGACATCTACCCCAATTGGCCTATGTTTGTGAAGAGTCCTACACATCCTACAGACGAGAAGAGCAAGAGATTCAAGGTGATGCAGGAAGCTGCTCGCAAGGATATTGAACGAGCATTCGATGTTCTTCAATCTCGGTGGGCTATCATAAAAGGACCAGCGCGTCTTTGGAGCAAGGCGGAGTTGAGTGATATCATGTTCACGTGCATCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770220.1
MFQVNNSYYQKGYYLTDDIYPNWPMFVKSPTHPTDEKSKRFKVMQEAARKDIERAFDVLQSRWAIIKGPARLWSKAELSDIMFTCIILHNMIVQDEGEHGTEWADEGNDDASSSYAAARPRTGAPLEFRQYVARQASMRDAEMHARLTLDLKEYIWSRFGPIKH

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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