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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000245`

染色体: Chr06 坐标: 1637044-1638905 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000245`
名称	SmilChr06G000245
描述	30S ribosomal protein S21, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	1637044 - 1638905 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987820`
GeneID	`130987820`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987820`
原始查询	`SmilChr06G000245`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	30S ribosomal protein S21, chloroplastic-like
产物	30S ribosomal protein S21%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT3G27160` (GHS1) Ribosomal protein S21 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822335] identity=46.1; qcov=0.587; evalue=2.46e-30; confidence=medium
Rice	`Os02g0189000` - identity=47.5; qcov=0.311; evalue=1.09e-11; confidence=low
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation)
KEGG	-
Pfam	PF01165 (Ribosomal_S21)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987820

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057767495.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767495.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767495.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767495.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057767495.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:1637135`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C15
`Chr6:1637135`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C15
`Chr6:1637152`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr6:1637219`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B130,B65,C27,C55
`Chr6:1637258`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr6:1637278`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B130,B65,C27,C55
`Chr6:1637345`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:1637448`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C41
`Chr6:1637504`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24
`Chr6:1637557`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C78
`Chr6:1638600`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B14,B26,C21,C40

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767495.1

196 aa

196

Ribosomal_S21

PF01165 Ribosomal_S21 103-154 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767495.1`	Pfam	`PF01165`	Ribosomal_S21	Family	103	154	4e-13	49.6	Ribosomal protein S21

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911512.1
TAACTACTTCACTTTCATCTCTTACTTTATTTTCGTGGGAATCAATCGAAGAATCCCAAAATTAATGGCGGTTTCCAAGCTTAATCCCCTCTACTTGCTGCCCCCTCACAATCCAACCTCAATCCCTCAACCCCCAAATCTTCCTCTTCTCCCCTTCAAAGACCCCTCAGCTCCTCTCTCTCTCAAAACCCGTCTCAATCTCTGCAATTTGCTGCGGGAAACTCCATTCAAAACCACCATTAACCAAAATGAAGAACAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987820
ATGGCGGTTTCCAAGCTTAATCCCCTCTACTTGCTGCCCCCTCACAATCCAACCTCAATCCCTCAACCCCCAAATCTTCCTCTTCTCCCCTTCAAAGACCCCTCAGCTCCTCTCTCTCTCAAAACCCGTCTCAATCTCTGCAATTTGCTGCGGGAAACTCCATTCAAAACCACCATTAACCAAAATGAAGAACAAAAAGAGGGCCCATTTAATCACTACTGCGAAAAGGCTGATTCTCTCTCGGTGGCTTTCCCTGCGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767495.1
MAVSKLNPLYLLPPHNPTSIPQPPNLPLLPFKDPSAPLSLKTRLNLCNLLRETPFKTTINQNEEQKEGPFNHYCEKADSLSVAFPALAFSNTLFFATNVALIVGEDDHEEKLISRFRREVLKAGVLQECRRRRFFECSQEKRKRKSREAARRNRKRRPRPQPKDQTKDKAETSKKKTQDTDGDDNWEYYDIDLPYS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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