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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000253`

染色体: Chr06 坐标: 1675512-1677047 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000253`
名称	SmilChr06G000253
描述	stemmadenine O-acetyltransferase-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	1675512 - 1677047 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987807`
GeneID	`130987807`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987807`
原始查询	`SmilChr06G000253`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	stemmadenine O-acetyltransferase-like
产物	stemmadenine O-acetyltransferase-like
Arabidopsis	`AT1G24430` (AT1G24430) HXXXD-type acyl-transferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839059] identity=40.3; qcov=1.02; evalue=3.27e-98; confidence=medium
Rice	`Os02g0611800` (OsHCT2) - identity=23.4; qcov=1.06; evalue=1.52e-32; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02458 (Transferase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987807

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057767473.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057767473.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767473.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767473.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767473.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:1675739`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B104,B93,C3
`Chr6:1675739`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B104,B93,C3
`Chr6:1675750`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B104,B93
`Chr6:1675750`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B104,B93
`Chr6:1675775`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C21,C87
`Chr6:1675807`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	47	A1,A11,A13,A20,A23,A9,B110,B114,B120,B121,B123,B124,B125,B127,B140,B2,B20,B26,B41,B44,B56,B6,B68,B73,B9,B96,C11,C13,C2,C21,C32,C33,C43,C49,C50,C52,C58,C64,C66,C67,C68,C69,C7,C76,C8,C82,D10
`Chr6:1675811`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C13,D10
`Chr6:1675814`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C8
`Chr6:1675830`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,D6
`Chr6:1675839`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B117,B57,B86,D3
`Chr6:1675874`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr6:1675895`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B14,C21,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767473.1

412 aa

206

412

Transferase

PF02458 Transferase 4-409 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767473.1`	Pfam	`PF02458`	Transferase	Family	4	409	1.6e-81	274.9	Transferase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911490.1
TTTTTGTGAATTTGTCTAAGCTGCCCATCATACCAAAATATCAATCATAGATTATTCTGCCAAAAAAAAGAAGAGGAATATATATATATATGGCTATAAAGGTGGAGATAATCTCACATGAGATGATTAAGCCTTCATCTCCAACTCCAACCCATCTCAGAAACCTCAAACTCTCCTTCTTAGACCAAATCGCACCTCCCATTTATGTTCCCCTCATTTTCTTCTACAACCATCATCAACTAACTCTCCAAAACCTCACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987807
ATGGCTATAAAGGTGGAGATAATCTCACATGAGATGATTAAGCCTTCATCTCCAACTCCAACCCATCTCAGAAACCTCAAACTCTCCTTCTTAGACCAAATCGCACCTCCCATTTATGTTCCCCTCATTTTCTTCTACAACCATCATCAACTAACTCTCCAAAACCTCACCCACCACCAAATCTCTCAGCTGCTCAAACAATCTCTATCCAAAACCCTAACTGTATTCTACCCCTTAGCAGGGAGGATTCACGAAAACTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767473.1
MAIKVEIISHEMIKPSSPTPTHLRNLKLSFLDQIAPPIYVPLIFFYNHHQLTLQNLTHHQISQLLKQSLSKTLTVFYPLAGRIHENSSIDCNDSGAEFIEARVHTRALSEILQEPSMEELKKLQPVEILGQDEKVVLKVKICFFDCGGISVAICLSHKIADGTSLVAFVNAWAASSRGEPQNFRPSFDFASVFPPRDLSGLDFTQRIGMTEERIATKRLVFDKEELAKLRNSESSQVKNPTRVEAVSSYIWRRFMDAAKD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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