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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000259`

染色体: Chr06 坐标: 1704409-1711253 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000259`
名称	SmilChr06G000259
描述	transcription factor GTE10-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	1704409 - 1711253 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987781`
GeneID	`130987781`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987781`
原始查询	`SmilChr06G000259`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor GTE10-like
产物	transcription factor GTE10-like
Arabidopsis	`AT5G63320` (NPX1) nuclear protein X1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836452] identity=46.2; qcov=0.963; evalue=2.44e-146; confidence=high
Rice	`Os02g0601800` (OJ1791_B03.42-2) - identity=37.6; qcov=1.03; evalue=1.19e-105; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00439 (Bromodomain); PF17035 (BET)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987781

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057767437.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767437.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767437.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057767437.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057767437.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:1704855`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C6,C60
`Chr6:1704885`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr6:1704952`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr6:1704962`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:1705584`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B16,B82,C51
`Chr6:1705955`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:1708797`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,C75,C87
`Chr6:1708895`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:1708932`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C6,C60
`Chr6:1709366`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr6:1709390`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:1709424`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B16,B82,C51

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767437.1

774 aa

387

774

Bromodomain

BET

PF00439 Bromodomain 218-302 aa PF17035 BET 366-428 aa

XP_057767438.1

774 aa

387

774

Bromodomain

BET

PF00439 Bromodomain 218-302 aa PF17035 BET 366-428 aa

XP_057767439.1

774 aa

387

774

Bromodomain

BET

PF00439 Bromodomain 218-302 aa PF17035 BET 366-428 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767437.1`	Pfam	`PF00439`	Bromodomain	Domain	218	302	7.2e-22	77.9	Bromodomain
`XP_057767437.1`	Pfam	`PF17035`	BET	Domain	366	428	3.8e-14	53.3	Bromodomain extra-terminal - transcription regulation
`XP_057767438.1`	Pfam	`PF00439`	Bromodomain	Domain	218	302	7.2e-22	77.9	Bromodomain
`XP_057767438.1`	Pfam	`PF17035`	BET	Domain	366	428	3.8e-14	53.3	Bromodomain extra-terminal - transcription regulation
`XP_057767439.1`	Pfam	`PF00439`	Bromodomain	Domain	218	302	7.2e-22	77.9	Bromodomain
`XP_057767439.1`	Pfam	`PF17035`	BET	Domain	366	428	3.8e-14	53.3	Bromodomain extra-terminal - transcription regulation

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911454.1
TGCTGCACTGAATTACTGAACTCGATTAATATTTTTGGCCATTAGATTAAACGGCACGAAATCGACGGTCGAAATTTGTTGCTGCTGTCGTCTTTAAAATGCCGTGATTTCTCGCAGCCCAAGCGCCTCAGCGATTCCCAAACTAGGATTCAGGTGTTGCATACAGTTGAAATTTCAGATTCCTAATGTCTACAGAACACGTTGAATGAGGAGGATTTGATATGTGTGCTCCTTCAGCTTTAAATTTATGGCACCAACCA...

XM_057911456.1
AGCGCCTCAGCGATTCCCAAACTAGTAAGTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCTTTTCACGCATGTGCATTTATCTCTTTTTCTAGGATTATGCAAATGCAAAATTTCAAGGAAAAAATCTCCAACTATTTTGCTTCTAGGGTTCTTGCGGAAGGGGTCGGGTCACCCGGTTCTTACCCTCGATATGCTTTTCTAATTTCTTTTCTGGATCCAAACGATTGCAATTGTATGTTTTCTTTCTACGTAGATTAGGTTTCGATT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130987781
ATGGCACCAACCATCCCGATAGACTACACGGGGCAAAAGGAGTCGAAAAAGTTTTCGAAGAAGGCGGGATCAGGGGATATGATGGGGAAGACTCGAAAAGTTTCTAAGGGTTACTCCAGTGGTTTTGTGCCGGATTATAGACATGCGGTTGAGACAGTTGCTGAATCAGAAGGTTTTGGGAACTCAGGCCGCGGTGATGCAGGGTTCAATTCTCTGCAGGAAAATTGTGCACCGAATGGGAAATGCATTAGTTTGAATGT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057767437.1
MAPTIPIDYTGQKESKKFSKKAGSGDMMGKTRKVSKGYSSGFVPDYRHAVETVAESEGFGNSGRGDAGFNSLQENCAPNGKCISLNVDGYGRSVVPIRSLSLSKMSSSERRDLEVKLKSELEQVRKLHRKIASFSMDRVVHPHATDIHNHQTGAKRLATAESLLVSTNDEAVTPGKKKGPSGRNGPRTKGGPVAARKTESVKQGLPQNTNFVILMKQCETLLNRLMLQPHAWIFNKPVDVVAHKVPDYYDIIKHPMDLGT...

XP_057767438.1
MAPTIPIDYTGQKESKKFSKKAGSGDMMGKTRKVSKGYSSGFVPDYRHAVETVAESEGFGNSGRGDAGFNSLQENCAPNGKCISLNVDGYGRSVVPIRSLSLSKMSSSERRDLEVKLKSELEQVRKLHRKIASFSMDRVVHPHATDIHNHQTGAKRLATAESLLVSTNDEAVTPGKKKGPSGRNGPRTKGGPVAARKTESVKQGLPQNTNFVILMKQCETLLNRLMLQPHAWIFNKPVDVVAHKVPDYYDIIKHPMDLGT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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