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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000260`

染色体: Chr06 坐标: 1714115-1715775 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000260`
名称	SmilChr06G000260
描述	uncharacterized SmilChr06G000260
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	1714115 - 1715775 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987810`
GeneID	`130987810`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987810`
原始查询	`SmilChr06G000260`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AtIII18x5-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824010]; symbol=AT3G48510; hit=AT3G48510; species=arabidopsis; confidence=high
产物	AtIII18x5-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824010]; symbol=AT3G48510; hit=AT3G48510; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G48510` (AT3G48510) AtIII18x5-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824010] identity=45; qcov=1.06; evalue=7.48e-63; confidence=high
Rice	`Os07g0585700` (SDR4) - identity=37.1; qcov=0.397; evalue=1.78e-08; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF25821 (DUF7950)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987810

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057767476.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767476.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767476.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057767476.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057767476.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:1714317`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C53
`Chr6:1714317`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr6:1714370`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr6:1714395`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:1714454`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B114,B125,B133,C8
`Chr6:1714588`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C37,D6
`Chr6:1714610`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B38,B39,C54
`Chr6:1714660`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr6:1714794`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B38,B39,D10
`Chr6:1714890`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr6:1714913`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B65,C27,C5,C55
`Chr6:1714916`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B40,B78,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767476.1

292 aa

146

292

DUF7950

PF25821 DUF7950 155-287 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767476.1`	Pfam	`PF25821`	DUF7950	Domain	155	287	2.1e-47	161.2	Domain of unknown function (DUF7950)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911493.1
CGGCTTAAGCTAGAGAGACCATTTTTCAAACATTTGGTACATGCAACAATTTGCATTTGAAATCTGGCTGTGAAGAAAGCATTTATTGAGAAAATATCTACTATCTCGGAGTGTCTCACCCAGCATTCAACAGCATTGGTCTATGTCAAAAACTGAAAACACCCCCGTCCACGTGTCGCAATCTGGCTGGCCGATCACCGCCGTTGGCCTCCACGTGCCCCCTTCTGGAACTTCCAGCAGCGTACACGGTGCCCCAGGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987810
ATGGATCAAAGGGGAGGGTGCTGTATAGCGCGCTACTCCGGGAGTGTGTACGATATCTCTAAGGTGGATAGGATAATGCTGAAGTTTCGTCCAATCGCTCCGAAACCGGCTTCCGCCAACGGATCTCTTTCCGGCGGAGGAAGCGGAAGCGGAAGCTCCAGCTCCGCCTCGCCGGAGAGCAGCGGCGCGAGAACTGGCCGCGGGAAGAGGAAGCATGCCGCGAAGGACGGCAGTGCTGGTAAGAGGTGTGGTCGGAGGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767476.1
MDQRGGCCIARYSGSVYDISKVDRIMLKFRPIAPKPASANGSLSGGGSGSGSSSSASPESSGARTGRGKRKHAAKDGSAGKRCGRRKRRCSPAKTDSGGSVSGGEKDPIKTLPLLPEAPDVREEATAASRQRYPLWLSFENGGRAEAVGRRVVASSWVKVECVTDTWLADFYPYGGIGNTDAERVRSLEADTCPGFVTDGLNRVRWTNPAYRRMAAGEAAAAGEGEVAAWLAVAEGVALPTRCAAFTCRVRLVTCGNEKA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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