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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000261`

染色体: Chr06 坐标: 1731682-1743710 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000261`
名称	SmilChr06G000261
描述	serine protease SPPA, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	1731682 - 1743710 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987788`
GeneID	`130987788`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987788`
原始查询	`SmilChr06G000261`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine protease SPPA, chloroplastic
产物	serine protease SPPA%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT1G73990` (SPPA) signal peptide peptidase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843737] identity=67.7; qcov=0.931; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0728100` (OsProtIV1) - identity=65; qcov=0.963; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0006465 (GO:0006465); GO:0008233 (peptidase activity); GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF01343 (Peptidase_S49)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987788

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057767446.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057767446.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.80000	`XP_057767446.1`
4	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.40000	`XP_057767446.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767446.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:1732015`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr6:1732044`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,B21
`Chr6:1732180`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr6:1733686`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4
`Chr6:1734725`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr6:1734969`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,B120,B140,C79,D4
`Chr6:1735054`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B98,C29
`Chr6:1735812`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C32,C51,C68
`Chr6:1740860`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:1742829`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4
`Chr6:1743182`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B125
`Chr6:1743228`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767446.1

672 aa

336

672

Peptidase_S49

PF01343 Peptidase_S49 190-339 aa PF01343 Peptidase_S49 440-591 aa

XP_057767447.1

569 aa

284

569

Peptidase_S49

PF01343 Peptidase_S49 190-339 aa PF01343 Peptidase_S49 440-549 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767446.1`	Pfam	`PF01343`	Peptidase_S49	Family	190	339	6.3e-63	212.1	Peptidase family S49
`XP_057767446.1`	Pfam	`PF01343`	Peptidase_S49	Family	440	591	6.3e-63	212.1	Peptidase family S49
`XP_057767447.1`	Pfam	`PF01343`	Peptidase_S49	Family	190	339	7.4e-49	166.4	Peptidase family S49
`XP_057767447.1`	Pfam	`PF01343`	Peptidase_S49	Family	440	549	7.4e-49	166.4	Peptidase family S49

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911463.1
ATTTTCCATCGAAATAAACGCGCCTTAAAAAAAATTATGGAAAGAGGTAGAAATTGAAAAATTGGGATTTGATAAATTGTGATATCTGAAATTATCAAGGCCTTAACAACTGCTACGAAGCTCAATCCTACACCTTGTGATTCACATCCTTTGAGTTTTGATACCTTTTCCTATGTAGCATTCATTATCCTCTCCGCCTCTCCTCAGCTCGGCGCAATGGCGAAAATGCTTCCTACAATCCACCTGCACACCACCTGTTC...

XM_057911464.1
AAACGCGCCTTAAAAAAAATTATGGAAAGAGGTAGAAATTGAAAAATTGGGATTTGATAAATTGTGATATCTGAAATTATCAAGGCCTTAACAACTGCTACGAAGCTCAATCCTACACCTTGTGATTCACATCCTTTGAGTTTTGATACCTTTTCCTATGTAGCATTCATTATCCTCTCCGCCTCTCCTCAGCTCGGCGCAATGGCGAAAATGCTTCCTACAATCCACCTGCACACCACCTGTTCGATGAAATGCCAGCC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130987788
ATGGCGAAAATGCTTCCTACAATCCACCTGCACACCACCTGTTCGATGAAATGCCAGCCGTCTTTTTCTATGCTTCCCTCGACGCGTCACTTAGAGAAGAAGCCGCAGTTGTTGCACCACAGGAATCGCAGTTTCCAGCGCCTCCCGATCAGGTCGTTGGAGACGGAGAGCGACGGGAAATTATCCGATGGCGGGAGAGAGGAAGCTGAGCTGGCGGGTGATGTAAGCGCTGGTTCTAGCTCCCACGTTGATGATGAGTA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057767446.1
MAKMLPTIHLHTTCSMKCQPSFSMLPSTRHLEKKPQLLHHRNRSFQRLPIRSLETESDGKLSDGGREEAELAGDVSAGSSSHVDDEYPTGEFVYRDNDLWKDLVVKSRMLIAWPWQRVKKGSVLTMKIRGEISDQLKSRFSSGLSLPQICENFVKAAYDPRISGIYLHIEPLNCGWGKVEEIHRHVVDFKKSGKFIVGYVPVCGEKEYYIGSVCEELYAPPSAYFQLYGLTVQASFLGGVLEKIGIEPQVQRIGKYKSAG...

XP_057767447.1
MAKMLPTIHLHTTCSMKCQPSFSMLPSTRHLEKKPQLLHHRNRSFQRLPIRSLETESDGKLSDGGREEAELAGDVSAGSSSHVDDEYPTGEFVYRDNDLWKDLVVKSRMLIAWPWQRVKKGSVLTMKIRGEISDQLKSRFSSGLSLPQICENFVKAAYDPRISGIYLHIEPLNCGWGKVEEIHRHVVDFKKSGKFIVGYVPVCGEKEYYIGSVCEELYAPPSAYFQLYGLTVQASFLGGVLEKIGIEPQVQRIGKYKSAG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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