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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000263`

染色体: Chr06 坐标: 1758554-1760264 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000263`
名称	SmilChr06G000263
描述	uncharacterized SmilChr06G000263
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	1758554 - 1760264 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990041`
GeneID	`130990041`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990041`
原始查询	`SmilChr06G000263`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc ion binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821674]; symbol=AT3G21210; hit=AT3G21210; species=arabidopsis; confidence=low
产物	zinc ion binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821674]; symbol=AT3G21210; hit=AT3G21210; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G21210` (AT3G21210) zinc ion binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821674] identity=27.7; qcov=0.724; evalue=7e-24; confidence=low
Rice	`Os07g0611200` - identity=30.1; qcov=0.364; evalue=4.12e-08; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03107 (C1_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990041

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057770225.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057770225.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770225.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770225.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770225.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:1758590`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	9	B119,B129,B21,B6,B74,C10,C42,C47,C67
`Chr6:1758594`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	9	B119,B129,B21,B6,B74,C10,C42,C47,C67
`Chr6:1758618`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr6:1758686`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:1758743`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B68,C16
`Chr6:1758757`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B60,C27
`Chr6:1758775`	`T`	`TAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	25	A13,A15,B104,B105,B125,B131,B21,B34,B51,B6,B61,B79,B86,B88,C10,C36,C47,C60,C67,C69,C72,C74,C78,D8,D9
`Chr6:1758813`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:1758822`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B13,B60,C70
`Chr6:1758825`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,C70,D3
`Chr6:1758830`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	A23,B122
`Chr6:1758830`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,B122

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770225.1

428 aa

214

428

C1_2

PF03107 C1_2 192-234 aa PF03107 C1_2 303-351 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770225.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	192	234	8.1e-21	74.8	C1 domain
`XP_057770225.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	303	351	8.1e-21	74.8	C1 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914242.1
ATGTCATGGAACCGCCTGTGCCACGTCACCCGAGCCACCGTTTCATTTGTCAAAACTAAAGGCTCCTCAATGCTCCTCGCGACGACGCGAACGAGCGAAGTGCAAAACATTACCAAGGGTCCAATAGATGACATATATGGGGAGATTATCATACCATTTGTTAAGAGAGAGAGAGAACAAATTACCATCCCTCAGAAGACCTGTGACAAATACAAGTTCCCCAATCACCCTCATCATCTACTAAGTTTTACTATATTTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990041
ATGTCATGGAACCGCCTGTGCCACGTCACCCGAGCCACCGTTTCATTTGTCAAAACTAAAGGCTCCTCAATGCTCCTCGCGACGACGCGAACGAGCGAAGTGCAAAACATTACCAAGGGTCCAATAGATGACATATATGGGGAGATTATCATACCATTTGTTAAGAGAGAGAGAGAACAAATTACCATCCCTCAGAAGACCTGTGACAAATACAAGTTCCCCAATCACCCTCATCATCTACTAAGTTTTACTATATTTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770225.1
MSWNRLCHVTRATVSFVKTKGSSMLLATTRTSEVQNITKGPIDDIYGEIIIPFVKREREQITIPQKTCDKYKFPNHPHHLLSFTIFSSSPSSSSSHHHNHEKEEGEYEEEEEEDDDDDDDDDDDDDEDSSISRSELTCDGCTLPIHEKKQRDDNEYENGYMSCDECKYFLHLSCFNLPPHLSSLPLHPIQNHDLTLLNAGKLTCWALCSICRGYTNGLVYKCTQCYFTIDIKCASLPNTIKHAAHPQPYHLMNLVMDNLW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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